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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.469970Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 285 / 3316537 191 / 2498449 4471 / 114162531 4593 / 109592465 285 / 3316537 191 / 2498449 4471 / 114162531 4593 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 2 / 57865 -- 6 / 83577 2 / 16077 2 / 57865 -- 6 / 83577
bone marrow   4 / 29891 105 / 5047110 69 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 105 / 5047110 69 / 4978364
brain 28 / 506301 21 / 200215 36 / 729526 150 / 4997811 28 / 506301 21 / 200215 36 / 729526 150 / 4997811
cartilage   6 / 37226 -- 57 / 778035 0 / 15965 6 / 37226 -- 57 / 778035
cerebellum 9 / 90353     26 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 0 / 90885 26 / 1495938
cerebrum 14 / 198932 1 / 3422 -- -- 14 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 11 / 151167 2 / 98089 22 / 643586 4 / 26551 11 / 151167 2 / 98089 22 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564   -- -- 5 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 13 / 128826 2 / 46440   976 / 12434232 13 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 976 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 3 / 12721   -- 3 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 8 / 76442   1 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 5 / 106627 16 / 89898 4 / 155372 2 / 100281 5 / 106627 16 / 89898 4 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 13 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 11 / 128150 10 / 170663 5 / 159917 12 / 159059 11 / 128150 10 / 170663 5 / 159917 12 / 159059
lymph node 2 / 62650   143 / 5278419 34 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 143 / 5278419 34 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 10 / 44303 -- -- 2 / 17836 10 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 8 / 104307 2166 / 43166038 1977 / 30312656 9 / 46553 8 / 104307 2166 / 43166038 1977 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 5 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 5 / 94887 6 / 179472
pancreas   10 / 74930 5 / 85728 8 / 189999 0 / 7237 10 / 74930 5 / 85728 8 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 29 / 241088 3 / 39531 3 / 207348 -- 29 / 241088 3 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 4 / 107080 6 / 266949 6 / 491794 9 / 79993 4 / 107080 6 / 266949 6 / 491794
retina 4 / 29438 -- 17 / 820326   4 / 29438 -- 17 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 4 / 125377 672 / 26905847 476 / 34522313 11 / 73633 4 / 125377 672 / 26905847 476 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 287 / 6230144 -- -- -- 287 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 3 / 124767 23 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 3 / 124767 23 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 6 / 100058 -- 739 / 12372003 3 / 143630 6 / 100058 -- 739 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737   1 / 115938 3 / 124664 5 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 36 / 479819 1 / 21833   19 / 207932 36 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 10 / 133582 465 / 10193077 -- 3 / 38063 10 / 133582 465 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 502 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 502 / 13135050 --
white blood cells -- -- 41 / 846268 -- -- -- 41 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --