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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.464472Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 531 / 3316537 528 / 2498449 27209 / 114162531 21559 / 109592465 531 / 3316537 528 / 2498449 27209 / 114162531 21559 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 22 / 57865 -- 2 / 83577 2 / 16077 22 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 7 / 14774 3 / 29891 335 / 5047110 438 / 4978364 7 / 14774 3 / 29891 335 / 5047110 438 / 4978364
brain 15 / 506301 10 / 200215 73 / 729526 831 / 4997811 15 / 506301 10 / 200215 73 / 729526 831 / 4997811
cartilage 1 / 15965 2 / 37226 -- 248 / 778035 1 / 15965 2 / 37226 -- 248 / 778035
cerebellum 2 / 90353   8 / 90885 224 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 8 / 90885 224 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 2 / 44577 -- -- 1 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 13 / 26551 27 / 151167 29 / 98089 165 / 643586 13 / 26551 27 / 151167 29 / 98089 165 / 643586
ear 7 / 16130 -- -- -- 7 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 34 / 246043   -- -- 34 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 2 / 46440 17 / 85898 1240 / 12434232 16 / 128826 2 / 46440 17 / 85898 1240 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 -- 4 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 --
heart 23 / 76442   27 / 83063 -- 23 / 76442 0 / 1 27 / 83063 --
kidney 4 / 106627 17 / 89898 39 / 155372 18 / 100281 4 / 106627 17 / 89898 39 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 9 / 107249 11 / 66308 50 / 214987 10 / 96846 9 / 107249 11 / 66308 50 / 214987
lung 36 / 128150 16 / 170663 79 / 159917 21 / 159059 36 / 128150 16 / 170663 79 / 159917 21 / 159059
lymph node 7 / 62650 5 / 27007 1207 / 5278419 537 / 4863489 7 / 62650 5 / 27007 1207 / 5278419 537 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 61 / 104307 9754 / 43166038 9960 / 30312656 5 / 46553 61 / 104307 9754 / 43166038 9960 / 30312656
muscle 1 / 74039 3 / 27691 4 / 107836 7 / 61270 1 / 74039 3 / 27691 4 / 107836 7 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 14 / 89988 82 / 94887 49 / 179472 2 / 11462 14 / 89988 82 / 94887 49 / 179472
pancreas 4 / 7237 5 / 74930 5 / 85728 72 / 189999 4 / 7237 5 / 74930 5 / 85728 72 / 189999
pancreatic islet 29 / 96524 22 / 30072 -- -- 29 / 96524 22 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 47 / 241088 1 / 39531 67 / 207348 -- 47 / 241088 1 / 39531 67 / 207348 --
pooled tissue 66 / 276455   -- -- 66 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 10 / 79993 18 / 107080 124 / 266949 134 / 491794 10 / 79993 18 / 107080 124 / 266949 134 / 491794
retina 24 / 29438 -- 54 / 820326 9 / 88490 24 / 29438 -- 54 / 820326 9 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 29 / 73633 6 / 125377 5803 / 26905847 5992 / 34522313 29 / 73633 6 / 125377 5803 / 26905847 5992 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 910 / 6230144 -- -- -- 910 / 6230144 --
stomach 21 / 26641 23 / 65644 13 / 124767 197 / 448716 21 / 26641 23 / 65644 13 / 124767 197 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 9 / 100058 -- 1301 / 12372003 9 / 143630 9 / 100058 -- 1301 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 45 / 32606 40 / 115938 56 / 124664 1 / 11737 45 / 32606 40 / 115938 56 / 124664
uncharacterized tissue 58 / 207932 81 / 479819 33 / 21833 8 / 51729 58 / 207932 81 / 479819 33 / 21833 8 / 51729
uterus 7 / 38063 107 / 133582 1268 / 10193077 -- 7 / 38063 107 / 133582 1268 / 10193077 --
vascular 14 / 46250 -- 7038 / 13135050 -- 14 / 46250 -- 7038 / 13135050 --
white blood cells -- -- 185 / 846268 -- -- -- 185 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --