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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.464416Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 318 / 3316537 295 / 2498449 501 / 114162531 256 / 109592465 318 / 3316537 295 / 2498449 501 / 114162531 256 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 7 / 57865 --   1 / 16077 7 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 4 / 29891 3 / 5047110   1 / 14774 4 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 80 / 506301 25 / 200215 3 / 729526 27 / 4997811 80 / 506301 25 / 200215 3 / 729526 27 / 4997811
cartilage 6 / 15965 2 / 37226 -- 2 / 778035 6 / 15965 2 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 6 / 90353     9 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 0 / 90885 9 / 1495938
cerebrum 28 / 198932   -- -- 28 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon   8 / 151167   2 / 643586 0 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 27 / 246043   -- -- 27 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye   5 / 46440 3 / 85898 31 / 12434232 0 / 128826 5 / 46440 3 / 85898 31 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803     -- 3 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 11 / 76442   3 / 83063 -- 11 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 17 / 106627 8 / 89898 7 / 155372 18 / 100281 17 / 106627 8 / 89898 7 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 37 / 107249 1 / 66308   4 / 96846 37 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 12 / 128150 17 / 170663     12 / 128150 17 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 10 / 62650 1 / 27007 11 / 5278419 2 / 4863489 10 / 62650 1 / 27007 11 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 10 / 104307 14 / 43166038 58 / 30312656 1 / 46553 10 / 104307 14 / 43166038 58 / 30312656
muscle 8 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 8 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   9 / 89988     0 / 11462 9 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   4 / 74930     0 / 7237 4 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 6 / 39531 111 / 207348 -- 13 / 241088 6 / 39531 111 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 15 / 107080 1 / 266949 1 / 491794 6 / 79993 15 / 107080 1 / 266949 1 / 491794
retina 1 / 29438 -- 3 / 820326   1 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 16 / 73633 15 / 125377 82 / 26905847 54 / 34522313 16 / 73633 15 / 125377 82 / 26905847 54 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 20 / 6230144 -- -- -- 20 / 6230144 --
stomach 2 / 26641   1 / 124767 1 / 448716 2 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 18 / 100058 -- 48 / 12372003 5 / 143630 18 / 100058 -- 48 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 68 / 479819   1 / 51729 21 / 207932 68 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 6 / 38063 15 / 133582 219 / 10193077 -- 6 / 38063 15 / 133582 219 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 13 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 13 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --