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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.460109Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 778 / 3316537 291 / 2498449 3023 / 114162531 460 / 109592465 778 / 3316537 291 / 2498449 3023 / 114162531 460 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 3 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow 2 / 14774   3 / 5047110   2 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 25 / 506301 1 / 200215 40 / 729526 23 / 4997811 25 / 506301 1 / 200215 40 / 729526 23 / 4997811
cartilage   8 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 8 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum       4 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 24 / 198932   -- -- 24 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 109 / 26551 78 / 151167     109 / 26551 78 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 51 / 128826     139 / 12434232 51 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 139 / 12434232
gastrointestinal tract 31 / 28803     -- 31 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442   1 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 8 / 106627 2 / 89898 1 / 155372   8 / 106627 2 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846   1 / 66308   6 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 31 / 128150 13 / 170663 2 / 159917 1 / 159059 31 / 128150 13 / 170663 2 / 159917 1 / 159059
lymph node 7 / 62650 1 / 27007 10 / 5278419 8 / 4863489 7 / 62650 1 / 27007 10 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular   6 / 44303 -- -- 0 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 21 / 46553 19 / 104307 12 / 43166038 81 / 30312656 21 / 46553 19 / 104307 12 / 43166038 81 / 30312656
muscle 48 / 74039   4 / 107836   48 / 74039 0 / 27691 4 / 107836 0 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 3 / 89988     2 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   8 / 74930 1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 2 / 30072 -- -- 6 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260 2 / 1358 -- -- 2 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 26 / 241088   3 / 207348 -- 26 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 208 / 79993 54 / 107080 165 / 266949 29 / 491794 208 / 79993 54 / 107080 165 / 266949 29 / 491794
retina   -- 3 / 820326   0 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     896 / 26905847 132 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 896 / 26905847 132 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 16 / 6230144 -- -- -- 16 / 6230144 --
stomach 15 / 26641 35 / 65644 4 / 124767 5 / 448716 15 / 26641 35 / 65644 4 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 42 / 143630   -- 28 / 12372003 42 / 143630 0 / 100058 -- 28 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 2 / 32606 6 / 115938 2 / 124664 3 / 11737 2 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 34 / 479819     4 / 207932 34 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 44 / 38063 20 / 133582 1834 / 10193077 -- 44 / 38063 20 / 133582 1834 / 10193077 --
vascular 13 / 46250 -- 21 / 13135050 -- 13 / 46250 -- 21 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --