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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.458355Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 961 / 3316537 464 / 2498449 5429 / 114162531 9169 / 109592465 961 / 3316537 464 / 2498449 5429 / 114162531 9169 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 8 / 57865 -- 34 / 83577 5 / 16077 8 / 57865 -- 34 / 83577
bone marrow 1 / 14774       1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 72 / 506301 27 / 200215 38 / 729526 305 / 4997811 72 / 506301 27 / 200215 38 / 729526 305 / 4997811
cartilage 67 / 15965 19 / 37226 -- 445 / 778035 67 / 15965 19 / 37226 -- 445 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 17 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 17 / 1495938
cerebrum 19 / 198932   -- -- 19 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 5 / 3888 2 / 44577 -- -- 5 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 12 / 26551 9 / 151167   1 / 643586 12 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 9 / 246043   -- -- 9 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 7 / 19564   -- -- 7 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270 10 / 17290 -- -- 1 / 270 10 / 17290 -- --
eye 23 / 128826   1 / 85898 27 / 12434232 23 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 27 / 12434232
gastrointestinal tract 101 / 28803     -- 101 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 21 / 76442   2 / 83063 -- 21 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 12 / 106627 18 / 89898 4 / 155372   12 / 106627 18 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 84 / 96846 68 / 107249 37 / 66308 1 / 214987 84 / 96846 68 / 107249 37 / 66308 1 / 214987
lung 74 / 128150 62 / 170663 10 / 159917 24 / 159059 74 / 128150 62 / 170663 10 / 159917 24 / 159059
lymph node   2 / 27007 165 / 5278419 27 / 4863489 0 / 62650 2 / 27007 165 / 5278419 27 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 12 / 46553 10 / 104307 2298 / 43166038 5961 / 30312656 12 / 46553 10 / 104307 2298 / 43166038 5961 / 30312656
muscle 7 / 74039     1 / 61270 7 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 7 / 11462 10 / 89988 1 / 94887 25 / 179472 7 / 11462 10 / 89988 1 / 94887 25 / 179472
pancreas   23 / 74930   18 / 189999 0 / 7237 23 / 74930 0 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 4 / 30072 -- -- 7 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 15 / 14891   -- -- 15 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 2 / 39531   -- 24 / 241088 2 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 45 / 79993 6 / 107080 27 / 266949 16 / 491794 45 / 79993 6 / 107080 27 / 266949 16 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 36 / 73633 5 / 125377 1087 / 26905847 2065 / 34522313 36 / 73633 5 / 125377 1087 / 26905847 2065 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 112 / 52939   -- -- 112 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 29 / 6230144 -- -- -- 29 / 6230144 --
stomach 21 / 26641 22 / 65644 1 / 124767 40 / 448716 21 / 26641 22 / 65644 1 / 124767 40 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 47 / 143630 2 / 100058 -- 162 / 12372003 47 / 143630 2 / 100058 -- 162 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 6 / 11737   7 / 115938   6 / 11737 0 / 32606 7 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 67 / 207932 66 / 479819     67 / 207932 66 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 87 / 133582 1702 / 10193077 -- 3 / 38063 87 / 133582 1702 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 16 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 16 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --