Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.448845Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 14 / 3316537 1 / 2498449 348416 / 114162531 253321 / 109592465 14 / 3316537 1 / 2498449 348416 / 114162531 253321 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 201 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 201 / 83577
bone marrow     25818 / 5047110 48359 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 25818 / 5047110 48359 / 4978364
brain 6 / 506301   1795 / 729526 10912 / 4997811 6 / 506301 0 / 200215 1795 / 729526 10912 / 4997811
cartilage     -- 2003 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 2003 / 778035
cerebellum 5 / 90353   495 / 90885 3603 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 495 / 90885 3603 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     597 / 98089 2450 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 597 / 98089 2450 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     283 / 85898 8051 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 283 / 85898 8051 / 12434232
gastrointestinal tract     82 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 82 / 45908 --
heart     66 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 66 / 83063 --
kidney   1 / 89898 465 / 155372 158 / 100281 0 / 106627 1 / 89898 465 / 155372 158 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     53 / 66308 780 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 53 / 66308 780 / 214987
lung     436 / 159917 563 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 436 / 159917 563 / 159059
lymph node     12234 / 5278419 2957 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 12234 / 5278419 2957 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     204581 / 43166038 86481 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 204581 / 43166038 86481 / 30312656
muscle     179 / 107836 135 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 179 / 107836 135 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     362 / 94887 792 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 362 / 94887 792 / 179472
pancreas     400 / 85728 981 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 400 / 85728 981 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     236 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 236 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     457 / 266949 1995 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 457 / 266949 1995 / 491794
retina   -- 2119 / 820326 60 / 88490 0 / 29438 -- 2119 / 820326 60 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   39382 / 26905847 65440 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 39382 / 26905847 65440 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4803 / 6230144 -- -- -- 4803 / 6230144 --
stomach     159 / 124767 792 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 159 / 124767 792 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 16326 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 16326 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     227 / 115938 196 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 227 / 115938 196 / 124664
uncharacterized tissue     44 / 21833 86 / 51729 0 / 207932 0 / 479819 44 / 21833 86 / 51729
uterus     40884 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 40884 / 10193077 --
vascular   -- 9972 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 9972 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2287 / 846268 -- -- -- 2287 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --