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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.448697Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 283 / 3316537 179 / 2498449 18494 / 114162531 27617 / 109592465 283 / 3316537 179 / 2498449 18494 / 114162531 27617 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 2 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 3 / 14774   5447 / 5047110 1062 / 4978364 3 / 14774 0 / 29891 5447 / 5047110 1062 / 4978364
brain 17 / 506301 20 / 200215 23 / 729526 627 / 4997811 17 / 506301 20 / 200215 23 / 729526 627 / 4997811
cartilage 2 / 15965 2 / 37226 -- 68 / 778035 2 / 15965 2 / 37226 -- 68 / 778035
cerebellum 16 / 90353   6 / 90885 357 / 1495938 16 / 90353 0 / 0 6 / 90885 357 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 10 / 151167 8 / 98089 38 / 643586 2 / 26551 10 / 151167 8 / 98089 38 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 60 / 246043   -- -- 60 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 1 / 2857 -- -- 3 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 11 / 46440 5 / 85898 2795 / 12434232 10 / 128826 11 / 46440 5 / 85898 2795 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   2 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart     5 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 1 / 106627 4 / 89898 19 / 155372 7 / 100281 1 / 106627 4 / 89898 19 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 7 / 107249 5 / 66308 12 / 214987 5 / 96846 7 / 107249 5 / 66308 12 / 214987
lung 6 / 128150 15 / 170663 18 / 159917 12 / 159059 6 / 128150 15 / 170663 18 / 159917 12 / 159059
lymph node 2 / 62650   686 / 5278419 153 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 686 / 5278419 153 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 2 / 44303 -- -- 5 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 3 / 104307 3524 / 43166038 14524 / 30312656 1 / 46553 3 / 104307 3524 / 43166038 14524 / 30312656
muscle 4 / 74039 10 / 27691 4 / 107836 4 / 61270 4 / 74039 10 / 27691 4 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 5 / 94887 32 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 5 / 94887 32 / 179472
pancreas 1 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 19 / 189999 1 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 19 / 189999
pancreatic islet 48 / 96524 6 / 30072 -- -- 48 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 5 / 39531 11 / 207348 -- 2 / 241088 5 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 13 / 107080 31 / 266949 33 / 491794 2 / 79993 13 / 107080 31 / 266949 33 / 491794
retina 2 / 29438 -- 117 / 820326 6 / 88490 2 / 29438 -- 117 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 24 / 73633 15 / 125377 3917 / 26905847 5822 / 34522313 24 / 73633 15 / 125377 3917 / 26905847 5822 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1204 / 6230144 -- -- -- 1204 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 3 / 65644 12 / 124767 49 / 448716 4 / 26641 3 / 65644 12 / 124767 49 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 1 / 100058 -- 1980 / 12372003 3 / 143630 1 / 100058 -- 1980 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   30 / 115938 10 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 30 / 115938 10 / 124664
uncharacterized tissue 37 / 207932 20 / 479819   6 / 51729 37 / 207932 20 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus 5 / 38063 13 / 133582 1513 / 10193077 -- 5 / 38063 13 / 133582 1513 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 1766 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 1766 / 13135050 --
white blood cells -- -- 135 / 846268 -- -- -- 135 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --