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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.446574Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1077 / 3316537 751 / 2498449 64517 / 114162531 77671 / 109592465 1077 / 3316537 751 / 2498449 64517 / 114162531 77671 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 20 / 57865 -- 283 / 83577 1 / 16077 20 / 57865 -- 283 / 83577
bone marrow 31 / 14774 9 / 29891 15870 / 5047110 24294 / 4978364 31 / 14774 9 / 29891 15870 / 5047110 24294 / 4978364
brain 53 / 506301 60 / 200215 671 / 729526 4326 / 4997811 53 / 506301 60 / 200215 671 / 729526 4326 / 4997811
cartilage 1 / 15965 35 / 37226 -- 1803 / 778035 1 / 15965 35 / 37226 -- 1803 / 778035
cerebellum 3 / 90353   8 / 90885 1585 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 8 / 90885 1585 / 1495938
cerebrum 18 / 198932   -- -- 18 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 28 / 26551 38 / 151167 145 / 98089 947 / 643586 28 / 26551 38 / 151167 145 / 98089 947 / 643586
ear 7 / 16130 -- -- -- 7 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 74 / 246043   -- -- 74 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 7 / 2857 -- -- 3 / 19564 7 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 31 / 128826 3 / 46440 88 / 85898 5585 / 12434232 31 / 128826 3 / 46440 88 / 85898 5585 / 12434232
gastrointestinal tract 11 / 28803   14 / 45908 -- 11 / 28803 0 / 12721 14 / 45908 --
heart 20 / 76442   37 / 83063 -- 20 / 76442 0 / 1 37 / 83063 --
kidney 7 / 106627 28 / 89898 92 / 155372 256 / 100281 7 / 106627 28 / 89898 92 / 155372 256 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 143 / 96846 80 / 107249   163 / 214987 143 / 96846 80 / 107249 0 / 66308 163 / 214987
lung 85 / 128150 55 / 170663 288 / 159917 217 / 159059 85 / 128150 55 / 170663 288 / 159917 217 / 159059
lymph node   8 / 27007 2449 / 5278419 1738 / 4863489 0 / 62650 8 / 27007 2449 / 5278419 1738 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 15 / 46553 35 / 104307 16412 / 43166038 16505 / 30312656 15 / 46553 35 / 104307 16412 / 43166038 16505 / 30312656
muscle 15 / 74039 11 / 27691 14 / 107836 39 / 61270 15 / 74039 11 / 27691 14 / 107836 39 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 7 / 11462 32 / 89988 194 / 94887 392 / 179472 7 / 11462 32 / 89988 194 / 94887 392 / 179472
pancreas   39 / 74930 55 / 85728 537 / 189999 0 / 7237 39 / 74930 55 / 85728 537 / 189999
pancreatic islet   6 / 30072 -- -- 0 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   8 / 20557 -- -- 0 / 24 8 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088 3 / 39531 72 / 207348 -- 23 / 241088 3 / 39531 72 / 207348 --
pooled tissue 208 / 276455   -- -- 208 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 24 / 79993 56 / 107080 977 / 266949 370 / 491794 24 / 79993 56 / 107080 977 / 266949 370 / 491794
retina 5 / 29438 -- 90 / 820326 44 / 88490 5 / 29438 -- 90 / 820326 44 / 88490
salivary gland 2 / 2490 7 / 10368 -- -- 2 / 2490 7 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 32 / 125377 2623 / 26905847 12330 / 34522313 17 / 73633 32 / 125377 2623 / 26905847 12330 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2347 / 6230144 -- -- -- 2347 / 6230144 --
stomach 23 / 26641 18 / 65644 42 / 124767 549 / 448716 23 / 26641 18 / 65644 42 / 124767 549 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 31 / 143630 14 / 100058 -- 5660 / 12372003 31 / 143630 14 / 100058 -- 5660 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737 13 / 32606 21 / 115938 17 / 124664 4 / 11737 13 / 32606 21 / 115938 17 / 124664
uncharacterized tissue 114 / 207932 72 / 479819 204 / 21833 31 / 51729 114 / 207932 72 / 479819 204 / 21833 31 / 51729
uterus 1 / 38063 53 / 133582 12131 / 10193077 -- 1 / 38063 53 / 133582 12131 / 10193077 --
vascular 58 / 46250 -- 8434 / 13135050 -- 58 / 46250 -- 8434 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1239 / 846268 -- -- -- 1239 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --