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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.446260Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 415 / 3316537 471 / 2498449 11917 / 114162531 21783 / 109592465 415 / 3316537 471 / 2498449 11917 / 114162531 21783 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 14 / 57865 -- 4 / 83577 4 / 16077 14 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 3 / 14774 4 / 29891 364 / 5047110 809 / 4978364 3 / 14774 4 / 29891 364 / 5047110 809 / 4978364
brain 20 / 506301 33 / 200215 72 / 729526 1071 / 4997811 20 / 506301 33 / 200215 72 / 729526 1071 / 4997811
cartilage 1 / 15965 7 / 37226 -- 176 / 778035 1 / 15965 7 / 37226 -- 176 / 778035
cerebellum 5 / 90353   9 / 90885 375 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 9 / 90885 375 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   29 / 151167 5 / 98089 89 / 643586 0 / 26551 29 / 151167 5 / 98089 89 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 22 / 246043   -- -- 22 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 24 / 128826 7 / 46440 10 / 85898 696 / 12434232 24 / 128826 7 / 46440 10 / 85898 696 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721 4 / 45908 -- 0 / 28803 2 / 12721 4 / 45908 --
heart 21 / 76442   28 / 83063 -- 21 / 76442 0 / 1 28 / 83063 --
kidney 4 / 106627 17 / 89898 30 / 155372 21 / 100281 4 / 106627 17 / 89898 30 / 155372 21 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 24 / 107249 14 / 66308 91 / 214987 10 / 96846 24 / 107249 14 / 66308 91 / 214987
lung 56 / 128150 27 / 170663 38 / 159917 41 / 159059 56 / 128150 27 / 170663 38 / 159917 41 / 159059
lymph node   4 / 27007 962 / 5278419 1376 / 4863489 0 / 62650 4 / 27007 962 / 5278419 1376 / 4863489
lymphoreticular   6 / 44303 -- -- 0 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 17 / 104307 2061 / 43166038 5849 / 30312656 7 / 46553 17 / 104307 2061 / 43166038 5849 / 30312656
muscle 16 / 74039 3 / 27691 22 / 107836 4 / 61270 16 / 74039 3 / 27691 22 / 107836 4 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   10 / 89988 10 / 94887 14 / 179472 0 / 11462 10 / 89988 10 / 94887 14 / 179472
pancreas   5 / 74930 28 / 85728 41 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 28 / 85728 41 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524   -- -- 10 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid 1 / 24 37 / 20557 -- -- 1 / 24 37 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 10 / 39531 53 / 207348 -- 20 / 241088 10 / 39531 53 / 207348 --
pooled tissue 35 / 276455   -- -- 35 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 14 / 79993 51 / 107080 52 / 266949 111 / 491794 14 / 79993 51 / 107080 52 / 266949 111 / 491794
retina 2 / 29438 -- 60 / 820326 23 / 88490 2 / 29438 -- 60 / 820326 23 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 34 / 73633 17 / 125377 3487 / 26905847 7737 / 34522313 34 / 73633 17 / 125377 3487 / 26905847 7737 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1094 / 6230144 -- -- -- 1094 / 6230144 --
stomach 5 / 26641 7 / 65644 27 / 124767 91 / 448716 5 / 26641 7 / 65644 27 / 124767 91 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 13 / 100058 -- 3127 / 12372003 17 / 143630 13 / 100058 -- 3127 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606 20 / 115938 17 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 20 / 115938 17 / 124664
uncharacterized tissue 48 / 207932 101 / 479819 21 / 21833 20 / 51729 48 / 207932 101 / 479819 21 / 21833 20 / 51729
uterus 12 / 38063 16 / 133582 1408 / 10193077 -- 12 / 38063 16 / 133582 1408 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 1944 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 1944 / 13135050 --
white blood cells -- -- 94 / 846268 -- -- -- 94 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --