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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.445489Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1066 / 3316537 197 / 2498449 308 / 114162531 1093 / 109592465 1066 / 3316537 197 / 2498449 308 / 114162531 1093 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 498 / 506301 39 / 200215 36 / 729526 193 / 4997811 498 / 506301 39 / 200215 36 / 729526 193 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 108 / 90353   5 / 90885 6 / 1495938 108 / 90353 0 / 0 5 / 90885 6 / 1495938
cerebrum 282 / 198932   -- -- 282 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 14 / 151167   5 / 643586 2 / 26551 14 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 26 / 128826 11 / 46440 1 / 85898 515 / 12434232 26 / 128826 11 / 46440 1 / 85898 515 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803     -- 4 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 63 / 89898     3 / 106627 63 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 4 / 128150 14 / 170663   1 / 159059 4 / 128150 14 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node     21 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 21 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 2 / 104307 25 / 43166038 222 / 30312656 5 / 46553 2 / 104307 25 / 43166038 222 / 30312656
muscle 5 / 74039       5 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524   -- -- 14 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 15 / 6170 -- -- -- 15 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088 1 / 39531   -- 1 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 11 / 491794 2 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 11 / 491794
retina 59 / 29438 -- 119 / 820326 1 / 88490 59 / 29438 -- 119 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   30 / 125377 21 / 26905847 122 / 34522313 0 / 73633 30 / 125377 21 / 26905847 122 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 17 / 6230144 -- -- -- 17 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 1 / 65644   3 / 448716 2 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 1 / 100058 -- 10 / 12372003 8 / 143630 1 / 100058 -- 10 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737     2 / 124664 5 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 5 / 479819     2 / 207932 5 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 3 / 133582 56 / 10193077 -- 1 / 38063 3 / 133582 56 / 10193077 --
vascular   -- 3 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 3 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --