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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.445351Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 609 / 3316537 484 / 2498449 101549 / 114162531 101914 / 109592465 609 / 3316537 484 / 2498449 101549 / 114162531 101914 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 14 / 57865 -- 17 / 83577 2 / 16077 14 / 57865 -- 17 / 83577
bone marrow 9 / 14774 2 / 29891 58 / 5047110 623 / 4978364 9 / 14774 2 / 29891 58 / 5047110 623 / 4978364
brain 36 / 506301 97 / 200215 266 / 729526 4575 / 4997811 36 / 506301 97 / 200215 266 / 729526 4575 / 4997811
cartilage   15 / 37226 -- 1227 / 778035 0 / 15965 15 / 37226 -- 1227 / 778035
cerebellum 1 / 90353   16 / 90885 336 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 16 / 90885 336 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 1 / 44577 -- -- 2 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 14 / 151167 2 / 98089 2208 / 643586 1 / 26551 14 / 151167 2 / 98089 2208 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 48 / 128826   71 / 85898 1009 / 12434232 48 / 128826 0 / 46440 71 / 85898 1009 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   4 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 4 / 45908 --
heart 31 / 76442   110 / 83063 -- 31 / 76442 0 / 1 110 / 83063 --
kidney 7 / 106627 37 / 89898 49 / 155372 21 / 100281 7 / 106627 37 / 89898 49 / 155372 21 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 14 / 96846 20 / 107249 9 / 66308 267 / 214987 14 / 96846 20 / 107249 9 / 66308 267 / 214987
lung 51 / 128150 43 / 170663 369 / 159917 85 / 159059 51 / 128150 43 / 170663 369 / 159917 85 / 159059
lymph node   3 / 27007 2392 / 5278419 168 / 4863489 0 / 62650 3 / 27007 2392 / 5278419 168 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836   -- -- 5 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 27 / 46553 28 / 104307 6270 / 43166038 38082 / 30312656 27 / 46553 28 / 104307 6270 / 43166038 38082 / 30312656
muscle 35 / 74039 4 / 27691 71 / 107836 71 / 61270 35 / 74039 4 / 27691 71 / 107836 71 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 12 / 89988 632 / 94887 115 / 179472 4 / 11462 12 / 89988 632 / 94887 115 / 179472
pancreas   18 / 74930 40 / 85728 97 / 189999 0 / 7237 18 / 74930 40 / 85728 97 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 2 / 30072 -- -- 7 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 14 / 241088 2 / 39531 100 / 207348 -- 14 / 241088 2 / 39531 100 / 207348 --
pooled tissue 87 / 276455   -- -- 87 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 28 / 79993 19 / 107080 1230 / 266949 161 / 491794 28 / 79993 19 / 107080 1230 / 266949 161 / 491794
retina 3 / 29438 -- 233 / 820326 10 / 88490 3 / 29438 -- 233 / 820326 10 / 88490
salivary gland   17 / 10368 -- -- 0 / 2490 17 / 10368 -- --
skin 29 / 73633 76 / 125377 13455 / 26905847 51692 / 34522313 29 / 73633 76 / 125377 13455 / 26905847 51692 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 451 / 6230144 -- -- -- 451 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 6 / 65644 43 / 124767 274 / 448716 1 / 26641 6 / 65644 43 / 124767 274 / 448716
synovium   4 / 1650 -- -- 0 / 249 4 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 1 / 100058 -- 727 / 12372003 17 / 143630 1 / 100058 -- 727 / 12372003
thymus   1 / 165 -- -- 0 / 4478 1 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 52 / 115938 26 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 52 / 115938 26 / 124664
uncharacterized tissue 58 / 207932 15 / 479819 193 / 21833 123 / 51729 58 / 207932 15 / 479819 193 / 21833 123 / 51729
uterus 7 / 38063 24 / 133582 11660 / 10193077 -- 7 / 38063 24 / 133582 11660 / 10193077 --
vascular 35 / 46250 -- 62780 / 13135050 -- 35 / 46250 -- 62780 / 13135050 --
white blood cells -- -- 993 / 846268 -- -- -- 993 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --