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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.443625Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1440 / 3316537 867 / 2498449 8281 / 114162531 13837 / 109592465 1440 / 3316537 867 / 2498449 8281 / 114162531 13837 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 41 / 16077 70 / 57865 -- 824 / 83577 41 / 16077 70 / 57865 -- 824 / 83577
bone marrow 17 / 14774     3 / 4978364 17 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 3 / 4978364
brain 14 / 506301 56 / 200215 13 / 729526 266 / 4997811 14 / 506301 56 / 200215 13 / 729526 266 / 4997811
cartilage 2 / 15965 54 / 37226 -- 1434 / 778035 2 / 15965 54 / 37226 -- 1434 / 778035
cerebellum       40 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 40 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 1 / 44577 -- -- 1 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 9 / 26551 64 / 151167   10 / 643586 9 / 26551 64 / 151167 0 / 98089 10 / 643586
ear 169 / 16130 -- -- -- 169 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 506 / 246043   -- -- 506 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   8 / 17290 -- -- 0 / 270 8 / 17290 -- --
eye 112 / 128826   200 / 85898 36 / 12434232 112 / 128826 0 / 46440 200 / 85898 36 / 12434232
gastrointestinal tract 11 / 28803 3 / 12721   -- 11 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 77 / 76442   3 / 83063 -- 77 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 8 / 106627 28 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 28 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 10 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 5 / 96846 10 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 56 / 128150 39 / 170663 2 / 159917 57 / 159059 56 / 128150 39 / 170663 2 / 159917 57 / 159059
lymph node   4 / 27007 373 / 5278419 4 / 4863489 0 / 62650 4 / 27007 373 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 22 / 46553 41 / 104307 5531 / 43166038 3241 / 30312656 22 / 46553 41 / 104307 5531 / 43166038 3241 / 30312656
muscle 10 / 74039 2 / 27691   32 / 61270 10 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 32 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 21 / 89988 4 / 94887 100 / 179472 2 / 11462 21 / 89988 4 / 94887 100 / 179472
pancreas 19 / 7237 124 / 74930 2 / 85728 131 / 189999 19 / 7237 124 / 74930 2 / 85728 131 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524 7 / 30072 -- -- 14 / 96524 7 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 19 / 14891 2 / 645 -- -- 19 / 14891 2 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 96 / 241088   53 / 207348 -- 96 / 241088 0 / 39531 53 / 207348 --
pooled tissue 35 / 276455   -- -- 35 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 14 / 79993 10 / 107080 5 / 266949 6 / 491794 14 / 79993 10 / 107080 5 / 266949 6 / 491794
retina 9 / 29438 --   1 / 88490 9 / 29438 -- 0 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 36 / 73633 5 / 125377 1184 / 26905847 7496 / 34522313 36 / 73633 5 / 125377 1184 / 26905847 7496 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 108 / 6230144 -- -- -- 108 / 6230144 --
stomach 7 / 26641 70 / 65644 11 / 124767 112 / 448716 7 / 26641 70 / 65644 11 / 124767 112 / 448716
synovium 1 / 249   -- -- 1 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 4 / 100058 -- 39 / 12372003 7 / 143630 4 / 100058 -- 39 / 12372003
thymus 1 / 4478 2 / 165 -- -- 1 / 4478 2 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 18 / 32606 3 / 115938 3 / 124664 1 / 11737 18 / 32606 3 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 45 / 207932 160 / 479819 2 / 21833   45 / 207932 160 / 479819 2 / 21833 0 / 51729
uterus 46 / 38063 59 / 133582 614 / 10193077 -- 46 / 38063 59 / 133582 614 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 166 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 166 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --