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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.443428Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 65 / 3316537 28 / 2498449 3250 / 114162531 525 / 109592465 65 / 3316537 28 / 2498449 3250 / 114162531 525 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   -- 1 / 83577 2 / 16077 0 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     19 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 19 / 5047110 0 / 4978364
brain 2 / 506301 3 / 200215 38 / 729526 29 / 4997811 2 / 506301 3 / 200215 38 / 729526 29 / 4997811
cartilage   3 / 37226 --   0 / 15965 3 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum     2 / 90885 5 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 5 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   13 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 13 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 2 / 128826   1 / 85898 29 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 29 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 8 / 76442     -- 8 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898 4 / 155372   1 / 106627 1 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 2 / 107249 1 / 66308   1 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150 1 / 170663   1 / 159059 3 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node     16 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 16 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553   2435 / 43166038 262 / 30312656 1 / 46553 0 / 104307 2435 / 43166038 262 / 30312656
muscle 1 / 74039   1 / 107836   1 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas     1 / 85728   0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet   2 / 30072 -- -- 0 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 19 / 241088     -- 19 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080   5 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 5 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     165 / 26905847 98 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 165 / 26905847 98 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 106 / 6230144 -- -- -- 106 / 6230144 --
stomach       2 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 4 / 100058 -- 77 / 12372003 5 / 143630 4 / 100058 -- 77 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737   1 / 115938 1 / 124664 2 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue   4 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 0 / 207932 4 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus 3 / 38063 2 / 133582 132 / 10193077 -- 3 / 38063 2 / 133582 132 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 318 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 318 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --