Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.443258Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 321 / 3316537 503 / 2498449 4866 / 114162531 5114 / 109592465 321 / 3316537 503 / 2498449 4866 / 114162531 5114 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 -- 2 / 83577 0 / 16077 6 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow   4 / 29891 97 / 5047110 62 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 97 / 5047110 62 / 4978364
brain 32 / 506301 73 / 200215 50 / 729526 172 / 4997811 32 / 506301 73 / 200215 50 / 729526 172 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 13 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 13 / 778035
cerebellum 2 / 90353   6 / 90885 44 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 6 / 90885 44 / 1495938
cerebrum 33 / 198932   -- -- 33 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 27 / 151167 10 / 98089 37 / 643586 4 / 26551 27 / 151167 10 / 98089 37 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 42 / 246043   -- -- 42 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 21 / 128826 9 / 46440 5 / 85898 2308 / 12434232 21 / 128826 9 / 46440 5 / 85898 2308 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 8 / 12721   -- 1 / 28803 8 / 12721 0 / 45908 --
heart 18 / 76442   1 / 83063 -- 18 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 4 / 106627 14 / 89898 8 / 155372   4 / 106627 14 / 89898 8 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 7 / 107249   1 / 214987 6 / 96846 7 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 7 / 128150 15 / 170663 12 / 159917 3 / 159059 7 / 128150 15 / 170663 12 / 159917 3 / 159059
lymph node 33 / 62650 5 / 27007 242 / 5278419 11 / 4863489 33 / 62650 5 / 27007 242 / 5278419 11 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 27 / 44303 -- -- 1 / 17836 27 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 5 / 104307 982 / 43166038 927 / 30312656 3 / 46553 5 / 104307 982 / 43166038 927 / 30312656
muscle   2 / 27691 3 / 107836 4 / 61270 0 / 74039 2 / 27691 3 / 107836 4 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   20 / 89988 1 / 94887 7 / 179472 0 / 11462 20 / 89988 1 / 94887 7 / 179472
pancreas   24 / 74930 6 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 24 / 74930 6 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524   -- -- 8 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088 15 / 39531 1 / 207348 -- 16 / 241088 15 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 17 / 107080 4 / 266949 13 / 491794 8 / 79993 17 / 107080 4 / 266949 13 / 491794
retina 5 / 29438 -- 23 / 820326 3 / 88490 5 / 29438 -- 23 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 62 / 125377 2296 / 26905847 1225 / 34522313 6 / 73633 62 / 125377 2296 / 26905847 1225 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 411 / 6230144 -- -- -- 411 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 1 / 124767 17 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 1 / 124767 17 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 1 / 100058 -- 253 / 12372003 10 / 143630 1 / 100058 -- 253 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606   1 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 23 / 207932 125 / 479819   1 / 51729 23 / 207932 125 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 6 / 38063 11 / 133582 187 / 10193077 -- 6 / 38063 11 / 133582 187 / 10193077 --
vascular   -- 482 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 482 / 13135050 --
white blood cells -- -- 38 / 846268 -- -- -- 38 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --