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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.443061Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 147 / 3316537 125 / 2498449 1137 / 114162531 1039 / 109592465 147 / 3316537 125 / 2498449 1137 / 114162531 1039 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   5 / 29891 27 / 5047110 15 / 4978364 0 / 14774 5 / 29891 27 / 5047110 15 / 4978364
brain 16 / 506301 6 / 200215 10 / 729526 48 / 4997811 16 / 506301 6 / 200215 10 / 729526 48 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum 1 / 90353     32 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 32 / 1495938
cerebrum 14 / 198932   -- -- 14 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 6 / 643586 1 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 9 / 246043   -- -- 9 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye     2 / 85898 20 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 20 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   1 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 14 / 106627   2 / 155372   14 / 106627 0 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846     2 / 214987 3 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 12 / 128150 2 / 170663   1 / 159059 12 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 10 / 62650 1 / 27007 152 / 5278419 35 / 4863489 10 / 62650 1 / 27007 152 / 5278419 35 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   6 / 104307 36 / 43166038 246 / 30312656 0 / 46553 6 / 104307 36 / 43166038 246 / 30312656
muscle 5 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 3 / 61270 5 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 7 / 30072 -- -- 3 / 96524 7 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 1 / 39531   -- 11 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 3 / 107080 1 / 266949 3 / 491794 3 / 79993 3 / 107080 1 / 266949 3 / 491794
retina   -- 6 / 820326   0 / 29438 -- 6 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     349 / 26905847 326 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 349 / 26905847 326 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 101 / 6230144 -- -- -- 101 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 29 / 65644 4 / 124767 9 / 448716 1 / 26641 29 / 65644 4 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 7 / 100058 -- 286 / 12372003 7 / 143630 7 / 100058 -- 286 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737     1 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 40 / 479819     7 / 207932 40 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 4 / 133582 389 / 10193077 -- 3 / 38063 4 / 133582 389 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 47 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 47 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --