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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.438991Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 342 / 3316537 248 / 2498449 1338 / 114162531 1640 / 109592465 342 / 3316537 248 / 2498449 1338 / 114162531 1640 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 --   0 / 16077 6 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 3 / 14774 3 / 29891 45 / 5047110 14 / 4978364 3 / 14774 3 / 29891 45 / 5047110 14 / 4978364
brain 52 / 506301 22 / 200215 5 / 729526 94 / 4997811 52 / 506301 22 / 200215 5 / 729526 94 / 4997811
cartilage 3 / 15965 7 / 37226 -- 12 / 778035 3 / 15965 7 / 37226 -- 12 / 778035
cerebellum 6 / 90353     14 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 0 / 90885 14 / 1495938
cerebrum 19 / 198932 1 / 3422 -- -- 19 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 4 / 44577 -- -- 3 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 6 / 26551 16 / 151167   8 / 643586 6 / 26551 16 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 26 / 246043   -- -- 26 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 101 / 12434232 5 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 101 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 1 / 12721   -- 4 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 8 / 76442   1 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 16 / 106627 11 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 16 / 106627 11 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 2 / 214987 3 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 2 / 214987
lung 12 / 128150 10 / 170663 3 / 159917 2 / 159059 12 / 128150 10 / 170663 3 / 159917 2 / 159059
lymph node 2 / 62650   31 / 5278419 10 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 31 / 5278419 10 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 7 / 44303 -- -- 1 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 11 / 104307 133 / 43166038 726 / 30312656 6 / 46553 11 / 104307 133 / 43166038 726 / 30312656
muscle 5 / 74039 2 / 27691     5 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 8 / 89988 1 / 94887 4 / 179472 1 / 11462 8 / 89988 1 / 94887 4 / 179472
pancreas 1 / 7237 4 / 74930 2 / 85728 1 / 189999 1 / 7237 4 / 74930 2 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 23 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 20 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 3 / 491794 20 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 3 / 491794
retina   -- 7 / 820326   0 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 14 / 125377 351 / 26905847 487 / 34522313 8 / 73633 14 / 125377 351 / 26905847 487 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 8 / 52939   -- -- 8 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 93 / 6230144 -- -- -- 93 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 7 / 65644   3 / 448716 2 / 26641 7 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 26 / 100058 -- 145 / 12372003 17 / 143630 26 / 100058 -- 145 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737 6 / 32606 5 / 115938 11 / 124664 5 / 11737 6 / 32606 5 / 115938 11 / 124664
uncharacterized tissue 20 / 207932 51 / 479819   2 / 51729 20 / 207932 51 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 3 / 38063 9 / 133582 177 / 10193077 -- 3 / 38063 9 / 133582 177 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 464 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 464 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --