Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.438429Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1358 / 3316537 1326 / 2498449 290319 / 114162531 299560 / 109592465 1358 / 3316537 1326 / 2498449 290319 / 114162531 299560 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 19 / 57865 -- 13 / 83577 1 / 16077 19 / 57865 -- 13 / 83577
bone marrow 12 / 14774 27 / 29891 20412 / 5047110 25871 / 4978364 12 / 14774 27 / 29891 20412 / 5047110 25871 / 4978364
brain 42 / 506301 99 / 200215 484 / 729526 12251 / 4997811 42 / 506301 99 / 200215 484 / 729526 12251 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 542 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 542 / 778035
cerebellum 21 / 90353   80 / 90885 6005 / 1495938 21 / 90353 0 / 0 80 / 90885 6005 / 1495938
cerebrum 54 / 198932   -- -- 54 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 33 / 26551 150 / 151167 38 / 98089 2364 / 643586 33 / 26551 150 / 151167 38 / 98089 2364 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 193 / 246043   -- -- 193 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564   -- -- 6 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 27 / 128826 13 / 46440 92 / 85898 33000 / 12434232 27 / 128826 13 / 46440 92 / 85898 33000 / 12434232
gastrointestinal tract 13 / 28803 1 / 12721 30 / 45908 -- 13 / 28803 1 / 12721 30 / 45908 --
heart 64 / 76442   123 / 83063 -- 64 / 76442 0 / 1 123 / 83063 --
kidney 24 / 106627 98 / 89898 444 / 155372 964 / 100281 24 / 106627 98 / 89898 444 / 155372 964 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 65 / 96846 62 / 107249 93 / 66308 801 / 214987 65 / 96846 62 / 107249 93 / 66308 801 / 214987
lung 38 / 128150 87 / 170663 443 / 159917 249 / 159059 38 / 128150 87 / 170663 443 / 159917 249 / 159059
lymph node 3 / 62650 12 / 27007 40915 / 5278419 40374 / 4863489 3 / 62650 12 / 27007 40915 / 5278419 40374 / 4863489
lymphoreticular 9 / 17836 17 / 44303 -- -- 9 / 17836 17 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 44 / 104307 16113 / 43166038 96230 / 30312656 8 / 46553 44 / 104307 16113 / 43166038 96230 / 30312656
muscle 46 / 74039 22 / 27691 76 / 107836 171 / 61270 46 / 74039 22 / 27691 76 / 107836 171 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 17 / 11462 43 / 89988 409 / 94887 407 / 179472 17 / 11462 43 / 89988 409 / 94887 407 / 179472
pancreas   24 / 74930 122 / 85728 323 / 189999 0 / 7237 24 / 74930 122 / 85728 323 / 189999
pancreatic islet 23 / 96524 14 / 30072 -- -- 23 / 96524 14 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 12 / 13260   -- -- 12 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 18 / 241088 12 / 39531 550 / 207348 -- 18 / 241088 12 / 39531 550 / 207348 --
pooled tissue 261 / 276455   -- -- 261 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 82 / 79993 149 / 107080 2144 / 266949 1167 / 491794 82 / 79993 149 / 107080 2144 / 266949 1167 / 491794
retina 3 / 29438 -- 755 / 820326 321 / 88490 3 / 29438 -- 755 / 820326 321 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 18 / 73633 51 / 125377 107646 / 26905847 52743 / 34522313 18 / 73633 51 / 125377 107646 / 26905847 52743 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 19 / 52939   -- -- 19 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 11948 / 6230144 -- -- -- 11948 / 6230144 --
stomach 8 / 26641 11 / 65644 254 / 124767 1110 / 448716 8 / 26641 11 / 65644 254 / 124767 1110 / 448716
synovium   4 / 1650 -- -- 0 / 249 4 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 52 / 100058 -- 23949 / 12372003 10 / 143630 52 / 100058 -- 23949 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   5 / 32606 350 / 115938 401 / 124664 0 / 11737 5 / 32606 350 / 115938 401 / 124664
uncharacterized tissue 146 / 207932 272 / 479819 74 / 21833 304 / 51729 146 / 207932 272 / 479819 74 / 21833 304 / 51729
uterus 19 / 38063 19 / 133582 32787 / 10193077 -- 19 / 38063 19 / 133582 32787 / 10193077 --
vascular 48 / 46250 -- 52457 / 13135050 -- 48 / 46250 -- 52457 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1480 / 846268 -- -- -- 1480 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --