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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.437379Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 111 / 3316537 64 / 2498449 13105 / 114162531 15116 / 109592465 111 / 3316537 64 / 2498449 13105 / 114162531 15116 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 10 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 10 / 83577
bone marrow     134 / 5047110 166 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 134 / 5047110 166 / 4978364
brain 22 / 506301 12 / 200215 139 / 729526 386 / 4997811 22 / 506301 12 / 200215 139 / 729526 386 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 46 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 46 / 778035
cerebellum 3 / 90353   9 / 90885 116 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 9 / 90885 116 / 1495938
cerebrum 17 / 198932   -- -- 17 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 2 / 151167 4 / 98089 34 / 643586 2 / 26551 2 / 151167 4 / 98089 34 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 6 / 128826   12 / 85898 3933 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 12 / 85898 3933 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 2 / 106627 5 / 89898 20 / 155372 10 / 100281 2 / 106627 5 / 89898 20 / 155372 10 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   5 / 107249   4 / 214987 0 / 96846 5 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 7 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 4 / 159059 7 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 4 / 159059
lymph node 1 / 62650   254 / 5278419 71 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 254 / 5278419 71 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 3659 / 43166038 2765 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 3659 / 43166038 2765 / 30312656
muscle 5 / 74039 1 / 27691 5 / 107836 8 / 61270 5 / 74039 1 / 27691 5 / 107836 8 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 21 / 94887 19 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 21 / 94887 19 / 179472
pancreas     7 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 7 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 8 / 241088 2 / 39531 7 / 207348 -- 8 / 241088 2 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   8 / 266949 47 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 8 / 266949 47 / 491794
retina   -- 31 / 820326 8 / 88490 0 / 29438 -- 31 / 820326 8 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 3 / 125377 2601 / 26905847 5054 / 34522313 1 / 73633 3 / 125377 2601 / 26905847 5054 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1227 / 6230144 -- -- -- 1227 / 6230144 --
stomach 1 / 26641     11 / 448716 1 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 10 / 100058 -- 2409 / 12372003 8 / 143630 10 / 100058 -- 2409 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606   3 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 2 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 3 / 207932 2 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 2 / 133582 1822 / 10193077 -- 2 / 38063 2 / 133582 1822 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 3103 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 3103 / 13135050 --
white blood cells -- -- 35 / 846268 -- -- -- 35 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --