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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.436873Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 258 / 3316537 150 / 2498449 13051 / 114162531 17804 / 109592465 258 / 3316537 150 / 2498449 13051 / 114162531 17804 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 7 / 16077 4 / 57865 -- 1 / 83577 7 / 16077 4 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 1 / 14774   2 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 0 / 4978364
brain 21 / 506301 11 / 200215 85 / 729526 1823 / 4997811 21 / 506301 11 / 200215 85 / 729526 1823 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 128 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 128 / 778035
cerebellum 2 / 90353   18 / 90885 209 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 18 / 90885 209 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 7 / 151167 3 / 98089 18 / 643586 1 / 26551 7 / 151167 3 / 98089 18 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 44 / 246043   -- -- 44 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 16 / 128826   12 / 85898 784 / 12434232 16 / 128826 0 / 46440 12 / 85898 784 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 11 / 12721 3 / 45908 -- 3 / 28803 11 / 12721 3 / 45908 --
heart 6 / 76442   35 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 35 / 83063 --
kidney 8 / 106627 9 / 89898 55 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 9 / 89898 55 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 11 / 107249 6 / 66308 37 / 214987 6 / 96846 11 / 107249 6 / 66308 37 / 214987
lung 16 / 128150 3 / 170663 22 / 159917 28 / 159059 16 / 128150 3 / 170663 22 / 159917 28 / 159059
lymph node 1 / 62650   532 / 5278419 53 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 532 / 5278419 53 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 8 / 104307 3135 / 43166038 8383 / 30312656 8 / 46553 8 / 104307 3135 / 43166038 8383 / 30312656
muscle 11 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 9 / 61270 11 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 9 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 41 / 94887 32 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 41 / 94887 32 / 179472
pancreas   8 / 74930 5 / 85728 42 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 5 / 85728 42 / 189999
pancreatic islet 13 / 96524   -- -- 13 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   7 / 20557 -- -- 0 / 24 7 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 1 / 39531 75 / 207348 -- 24 / 241088 1 / 39531 75 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 2 / 107080 27 / 266949 37 / 491794 3 / 79993 2 / 107080 27 / 266949 37 / 491794
retina 2 / 29438 -- 299 / 820326 24 / 88490 2 / 29438 -- 299 / 820326 24 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 5 / 125377 3020 / 26905847 5478 / 34522313 5 / 73633 5 / 125377 3020 / 26905847 5478 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 193 / 6230144 -- -- -- 193 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 9 / 65644 28 / 124767 72 / 448716 4 / 26641 9 / 65644 28 / 124767 72 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 7 / 100058 -- 575 / 12372003 2 / 143630 7 / 100058 -- 575 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   6 / 32606 36 / 115938 60 / 124664 0 / 11737 6 / 32606 36 / 115938 60 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 23 / 479819 1 / 21833 10 / 51729 2 / 207932 23 / 479819 1 / 21833 10 / 51729
uterus 11 / 38063 3 / 133582 3392 / 10193077 -- 11 / 38063 3 / 133582 3392 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 2003 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 2003 / 13135050 --
white blood cells -- -- 21 / 846268 -- -- -- 21 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --