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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.435001Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 175 / 3316537 125 / 2498449 1454 / 114162531 2032 / 109592465 175 / 3316537 125 / 2498449 1454 / 114162531 2032 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774   284 / 5047110 166 / 4978364 2 / 14774 0 / 29891 284 / 5047110 166 / 4978364
brain 28 / 506301 4 / 200215 8 / 729526 46 / 4997811 28 / 506301 4 / 200215 8 / 729526 46 / 4997811
cartilage 1 / 15965 4 / 37226 -- 11 / 778035 1 / 15965 4 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum     2 / 90885 6 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 6 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 5 / 151167   6 / 643586 3 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 192 / 12434232 2 / 128826 3 / 46440 1 / 85898 192 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803     -- 3 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 2 / 89898 2 / 155372   3 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 8 / 107249   2 / 214987 6 / 96846 8 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 9 / 128150 7 / 170663 3 / 159917   9 / 128150 7 / 170663 3 / 159917 0 / 159059
lymph node 4 / 62650 8 / 27007 72 / 5278419 15 / 4863489 4 / 62650 8 / 27007 72 / 5278419 15 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 6 / 104307 371 / 43166038 1115 / 30312656 4 / 46553 6 / 104307 371 / 43166038 1115 / 30312656
muscle 11 / 74039   1 / 107836 5 / 61270 11 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 5 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 4 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 4 / 94887 4 / 179472
pancreas   5 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524 3 / 30072 -- -- 8 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 4 / 39531   -- 13 / 241088 4 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 5 / 107080 8 / 266949 5 / 491794 2 / 79993 5 / 107080 8 / 266949 5 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 5 / 125377 234 / 26905847 288 / 34522313 9 / 73633 5 / 125377 234 / 26905847 288 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 52 / 6230144 -- -- -- 52 / 6230144 --
stomach   8 / 65644   4 / 448716 0 / 26641 8 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 5 / 100058 -- 164 / 12372003 4 / 143630 5 / 100058 -- 164 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 4 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 4 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 13 / 207932 22 / 479819     13 / 207932 22 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 9 / 133582 150 / 10193077 -- 4 / 38063 9 / 133582 150 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 209 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 209 / 13135050 --
white blood cells -- -- 49 / 846268 -- -- -- 49 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --