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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.434937Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 501 / 3316537 469 / 2498449 13183 / 114162531 22797 / 109592465 501 / 3316537 469 / 2498449 13183 / 114162531 22797 / 109592465
adrenal cortex -- 11 / 9928 -- -- -- 11 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   22 / 57865 -- 4 / 83577 0 / 16077 22 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 3 / 14774 6 / 29891 319 / 5047110 386 / 4978364 3 / 14774 6 / 29891 319 / 5047110 386 / 4978364
brain 8 / 506301 30 / 200215 108 / 729526 1723 / 4997811 8 / 506301 30 / 200215 108 / 729526 1723 / 4997811
cartilage 1 / 15965 5 / 37226 -- 250 / 778035 1 / 15965 5 / 37226 -- 250 / 778035
cerebellum 2 / 90353   7 / 90885 427 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 7 / 90885 427 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 11 / 26551 25 / 151167 41 / 98089 145 / 643586 11 / 26551 25 / 151167 41 / 98089 145 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 57 / 246043   -- -- 57 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 10 / 19564 1 / 2857 -- -- 10 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 22 / 128826 9 / 46440 32 / 85898 336 / 12434232 22 / 128826 9 / 46440 32 / 85898 336 / 12434232
gastrointestinal tract   8 / 12721 9 / 45908 -- 0 / 28803 8 / 12721 9 / 45908 --
heart 4 / 76442   17 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 17 / 83063 --
kidney 5 / 106627 17 / 89898 33 / 155372 50 / 100281 5 / 106627 17 / 89898 33 / 155372 50 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 12 / 96846 29 / 107249 49 / 66308 81 / 214987 12 / 96846 29 / 107249 49 / 66308 81 / 214987
lung 38 / 128150 29 / 170663 135 / 159917 62 / 159059 38 / 128150 29 / 170663 135 / 159917 62 / 159059
lymph node 2 / 62650 1 / 27007 512 / 5278419 421 / 4863489 2 / 62650 1 / 27007 512 / 5278419 421 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 10 / 46553 10 / 104307 2104 / 43166038 6577 / 30312656 10 / 46553 10 / 104307 2104 / 43166038 6577 / 30312656
muscle 7 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 6 / 61270 7 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 6 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 13 / 89988 34 / 94887 82 / 179472 2 / 11462 13 / 89988 34 / 94887 82 / 179472
pancreas 6 / 7237 18 / 74930 20 / 85728 135 / 189999 6 / 7237 18 / 74930 20 / 85728 135 / 189999
pancreatic islet 23 / 96524 9 / 30072 -- -- 23 / 96524 9 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260   -- -- 5 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 32 / 241088 10 / 39531 176 / 207348 -- 32 / 241088 10 / 39531 176 / 207348 --
pooled tissue 26 / 276455   -- -- 26 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 14 / 79993 21 / 107080 182 / 266949 503 / 491794 14 / 79993 21 / 107080 182 / 266949 503 / 491794
retina 2 / 29438 -- 80 / 820326 10 / 88490 2 / 29438 -- 80 / 820326 10 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 39 / 125377 1610 / 26905847 8113 / 34522313 17 / 73633 39 / 125377 1610 / 26905847 8113 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 792 / 6230144 -- -- -- 792 / 6230144 --
stomach 46 / 26641 20 / 65644 72 / 124767 187 / 448716 46 / 26641 20 / 65644 72 / 124767 187 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 6 / 100058 -- 3196 / 12372003 5 / 143630 6 / 100058 -- 3196 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 7 / 11737 10 / 32606 33 / 115938 64 / 124664 7 / 11737 10 / 32606 33 / 115938 64 / 124664
uncharacterized tissue 101 / 207932 65 / 479819 17 / 21833 39 / 51729 101 / 207932 65 / 479819 17 / 21833 39 / 51729
uterus 8 / 38063 39 / 133582 2039 / 10193077 -- 8 / 38063 39 / 133582 2039 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 4698 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 4698 / 13135050 --
white blood cells -- -- 63 / 846268 -- -- -- 63 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --