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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.433863Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 945 / 3316537 646 / 2498449 43821 / 114162531 52212 / 109592465 945 / 3316537 646 / 2498449 43821 / 114162531 52212 / 109592465
adrenal cortex -- 10 / 9928 -- -- -- 10 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 10 / 57865 --   2 / 16077 10 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 3 / 14774   118 / 5047110 122 / 4978364 3 / 14774 0 / 29891 118 / 5047110 122 / 4978364
brain 154 / 506301 58 / 200215 504 / 729526 2769 / 4997811 154 / 506301 58 / 200215 504 / 729526 2769 / 4997811
cartilage   10 / 37226 -- 54 / 778035 0 / 15965 10 / 37226 -- 54 / 778035
cerebellum 32 / 90353   71 / 90885 490 / 1495938 32 / 90353 0 / 0 71 / 90885 490 / 1495938
cerebrum 71 / 198932 1 / 3422 -- -- 71 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   25 / 44577 -- -- 0 / 3888 25 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 24 / 151167 2 / 98089 141 / 643586 3 / 26551 24 / 151167 2 / 98089 141 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 45 / 246043   -- -- 45 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 41 / 19564   -- -- 41 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 38 / 128826 24 / 46440 13 / 85898 6356 / 12434232 38 / 128826 24 / 46440 13 / 85898 6356 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 2 / 12721 7 / 45908 -- 3 / 28803 2 / 12721 7 / 45908 --
heart 30 / 76442   33 / 83063 -- 30 / 76442 0 / 1 33 / 83063 --
kidney 23 / 106627 19 / 89898 71 / 155372 33 / 100281 23 / 106627 19 / 89898 71 / 155372 33 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 27 / 96846 34 / 107249 65 / 66308 16 / 214987 27 / 96846 34 / 107249 65 / 66308 16 / 214987
lung 31 / 128150 48 / 170663 34 / 159917 30 / 159059 31 / 128150 48 / 170663 34 / 159917 30 / 159059
lymph node 12 / 62650 4 / 27007 893 / 5278419 550 / 4863489 12 / 62650 4 / 27007 893 / 5278419 550 / 4863489
lymphoreticular 6 / 17836 5 / 44303 -- -- 6 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 33 / 104307 1638 / 43166038 10192 / 30312656 5 / 46553 33 / 104307 1638 / 43166038 10192 / 30312656
muscle 17 / 74039 7 / 27691 35 / 107836 14 / 61270 17 / 74039 7 / 27691 35 / 107836 14 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 20 / 89988 24 / 94887 33 / 179472 5 / 11462 20 / 89988 24 / 94887 33 / 179472
pancreas 8 / 7237 11 / 74930 8 / 85728 24 / 189999 8 / 7237 11 / 74930 8 / 85728 24 / 189999
pancreatic islet 104 / 96524 34 / 30072 -- -- 104 / 96524 34 / 30072 -- --
parathyroid   15 / 20557 -- -- 0 / 24 15 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 6 / 13260 1 / 1358 -- -- 6 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 34 / 241088 28 / 39531 43 / 207348 -- 34 / 241088 28 / 39531 43 / 207348 --
pooled tissue 52 / 276455   -- -- 52 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 14 / 79993 25 / 107080 41 / 266949 162 / 491794 14 / 79993 25 / 107080 41 / 266949 162 / 491794
retina 14 / 29438 -- 439 / 820326 16 / 88490 14 / 29438 -- 439 / 820326 16 / 88490
salivary gland 1 / 2490 9 / 10368 -- -- 1 / 2490 9 / 10368 -- --
skin 40 / 73633 43 / 125377 21684 / 26905847 24803 / 34522313 40 / 73633 43 / 125377 21684 / 26905847 24803 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 6810 / 6230144 -- -- -- 6810 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 11 / 65644 21 / 124767 66 / 448716 4 / 26641 11 / 65644 21 / 124767 66 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 22 / 143630 14 / 100058 -- 6207 / 12372003 22 / 143630 14 / 100058 -- 6207 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 9 / 32606 99 / 115938 103 / 124664 2 / 11737 9 / 32606 99 / 115938 103 / 124664
uncharacterized tissue 50 / 207932 66 / 479819 9 / 21833 31 / 51729 50 / 207932 66 / 479819 9 / 21833 31 / 51729
uterus 12 / 38063 43 / 133582 4966 / 10193077 -- 12 / 38063 43 / 133582 4966 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 6121 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 6121 / 13135050 --
white blood cells -- -- 72 / 846268 -- -- -- 72 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --