Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.433738Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 188 / 3316537 77 / 2498449 934 / 114162531 1287 / 109592465 188 / 3316537 77 / 2498449 934 / 114162531 1287 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 5 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 5 / 83577
bone marrow     1 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 41 / 506301 15 / 200215 39 / 729526 116 / 4997811 41 / 506301 15 / 200215 39 / 729526 116 / 4997811
cartilage     -- 7 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 7 / 90353   9 / 90885 14 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 9 / 90885 14 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 14 / 643586 2 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 14 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 23 / 246043   -- -- 23 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 252 / 12434232 5 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 252 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 3 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 3 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 2 / 128150 20 / 170663 3 / 159917 6 / 159059 2 / 128150 20 / 170663 3 / 159917 6 / 159059
lymph node 2 / 62650   9 / 5278419 1 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 9 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     544 / 43166038 611 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 544 / 43166038 611 / 30312656
muscle 1 / 74039   4 / 107836 2 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 4 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 2 / 89988 2 / 94887 9 / 179472 5 / 11462 2 / 89988 2 / 94887 9 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 6 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524   -- -- 14 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 10 / 241088     -- 10 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 15 / 79993   4 / 266949 9 / 491794 15 / 79993 0 / 107080 4 / 266949 9 / 491794
retina 2 / 29438 -- 16 / 820326 1 / 88490 2 / 29438 -- 16 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 127 / 26905847 197 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 127 / 26905847 197 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 50 / 6230144 -- -- -- 50 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 35 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 35 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606     0 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 22 / 479819     6 / 207932 22 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   3 / 133582 76 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 76 / 10193077 --
vascular   -- 18 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 18 / 13135050 --
white blood cells -- -- 25 / 846268 -- -- -- 25 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --