Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.429434Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 71 / 3316537 89 / 2498449 3628 / 114162531 5693 / 109592465 71 / 3316537 89 / 2498449 3628 / 114162531 5693 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     6 / 5047110 62 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 6 / 5047110 62 / 4978364
brain 13 / 506301 21 / 200215 45 / 729526 175 / 4997811 13 / 506301 21 / 200215 45 / 729526 175 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 7 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum       60 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 60 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   5 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826     643 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 643 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney   3 / 89898 12 / 155372 8 / 100281 0 / 106627 3 / 89898 12 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 3 / 128150 3 / 170663 5 / 159917 2 / 159059 3 / 128150 3 / 170663 5 / 159917 2 / 159059
lymph node     15 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 15 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   5 / 104307 1012 / 43166038 749 / 30312656 0 / 46553 5 / 104307 1012 / 43166038 749 / 30312656
muscle 1 / 74039 5 / 27691   2 / 61270 1 / 74039 5 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 1 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 1 / 94887 6 / 179472
pancreas   1 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088 11 / 39531 8 / 207348 -- 15 / 241088 11 / 39531 8 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993   3 / 266949 2 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 2 / 491794
retina   -- 8 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 8 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 16 / 125377 1216 / 26905847 3910 / 34522313 4 / 73633 16 / 125377 1216 / 26905847 3910 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 54 / 6230144 -- -- -- 54 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630   -- 42 / 12372003 6 / 143630 0 / 100058 -- 42 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 1 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 8 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 5 / 207932 8 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus   5 / 133582 771 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 771 / 10193077 --
vascular   -- 446 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 446 / 13135050 --
white blood cells -- -- 19 / 846268 -- -- -- 19 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --