Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.424484Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 166 / 3316537 128 / 2498449 3055 / 114162531 2222 / 109592465 166 / 3316537 128 / 2498449 3055 / 114162531 2222 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 4 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow     33 / 5047110 103 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 33 / 5047110 103 / 4978364
brain 69 / 506301 18 / 200215 29 / 729526 120 / 4997811 69 / 506301 18 / 200215 29 / 729526 120 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 7 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 8 / 90353   1 / 90885 37 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 1 / 90885 37 / 1495938
cerebrum 26 / 198932   -- -- 26 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 4 / 151167 3 / 98089 26 / 643586 1 / 26551 4 / 151167 3 / 98089 26 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 8 / 128826   8 / 85898 582 / 12434232 8 / 128826 0 / 46440 8 / 85898 582 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 2 / 12721   -- 2 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   2 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 1 / 100281 1 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249   1 / 214987 0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 8 / 128150 3 / 170663 1 / 159917 4 / 159059 8 / 128150 3 / 170663 1 / 159917 4 / 159059
lymph node 2 / 62650 4 / 27007 18 / 5278419 4 / 4863489 2 / 62650 4 / 27007 18 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   6 / 104307 1208 / 43166038 358 / 30312656 0 / 46553 6 / 104307 1208 / 43166038 358 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 3 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 3 / 94887 6 / 179472
pancreas     1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland   1 / 1358 -- -- 0 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   7 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 8 / 107080 2 / 266949 8 / 491794 1 / 79993 8 / 107080 2 / 266949 8 / 491794
retina   -- 25 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 25 / 820326 3 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin   30 / 125377 788 / 26905847 806 / 34522313 0 / 73633 30 / 125377 788 / 26905847 806 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 145 / 6230144 -- -- -- 145 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 8 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 6 / 100058 -- 140 / 12372003 7 / 143630 6 / 100058 -- 140 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664 3 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 23 / 479819     5 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 3 / 133582 321 / 10193077 -- 1 / 38063 3 / 133582 321 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 440 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 440 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --