Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.42400Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 148 / 3316537 65 / 2498449 1484 / 114162531 713 / 109592465 148 / 3316537 65 / 2498449 1484 / 114162531 713 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 3 / 57865 --   1 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 26 / 5047110 38 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 26 / 5047110 38 / 4978364
brain 15 / 506301 1 / 200215 15 / 729526 68 / 4997811 15 / 506301 1 / 200215 15 / 729526 68 / 4997811
cartilage     -- 8 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 15 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 15 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 1 / 98089 11 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 11 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 10 / 246043   -- -- 10 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 48 / 12434232 2 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 48 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   3 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898     1 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 1 / 107249 2 / 66308 1 / 214987 1 / 96846 1 / 107249 2 / 66308 1 / 214987
lung 5 / 128150 6 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 5 / 128150 6 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node 11 / 62650 1 / 27007 157 / 5278419 5 / 4863489 11 / 62650 1 / 27007 157 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553   1034 / 43166038 331 / 30312656 3 / 46553 0 / 104307 1034 / 43166038 331 / 30312656
muscle 6 / 74039   1 / 107836   6 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462   1 / 94887   1 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas 2 / 7237 2 / 74930 5 / 85728 3 / 189999 2 / 7237 2 / 74930 5 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 2 / 30072 -- -- 12 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   1 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993     4 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 4 / 491794
retina 1 / 29438 -- 7 / 820326   1 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 3 / 125377 76 / 26905847 126 / 34522313 11 / 73633 3 / 125377 76 / 26905847 126 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 26 / 6230144 -- -- -- 26 / 6230144 --
stomach       3 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 1 / 100058 -- 48 / 12372003 12 / 143630 1 / 100058 -- 48 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 2 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 28 / 479819   1 / 51729 6 / 207932 28 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 2 / 38063 1 / 133582 54 / 10193077 -- 2 / 38063 1 / 133582 54 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 60 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 60 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --