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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.423348Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 125 / 3316537 164 / 2498449 2443 / 114162531 479 / 109592465 125 / 3316537 164 / 2498449 2443 / 114162531 479 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891     0 / 14774 2 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 19 / 506301 5 / 200215   2 / 4997811 19 / 506301 5 / 200215 0 / 729526 2 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum       2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 12 / 151167 1 / 98089 1 / 643586 1 / 26551 12 / 151167 1 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 1 / 46440 1 / 85898   4 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract   3 / 12721 3 / 45908 -- 0 / 28803 3 / 12721 3 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 8 / 89898     2 / 106627 8 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 6 / 107249   2 / 214987 3 / 96846 6 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 9 / 128150 7 / 170663 1 / 159917 5 / 159059 9 / 128150 7 / 170663 1 / 159917 5 / 159059
lymph node 9 / 62650 4 / 27007     9 / 62650 4 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   16 / 44303 -- -- 0 / 17836 16 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 1288 / 43166038 35 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 1288 / 43166038 35 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 1 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 1 / 94887 6 / 179472
pancreas   4 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088 3 / 39531   -- 7 / 241088 3 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 6 / 107080 12 / 266949 1 / 491794 3 / 79993 6 / 107080 12 / 266949 1 / 491794
retina   -- 3 / 820326   0 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 18 / 125377 1068 / 26905847 394 / 34522313 4 / 73633 18 / 125377 1068 / 26905847 394 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4 / 6230144 -- -- -- 4 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 25 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 25 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 2 / 100058 -- 2 / 12372003 5 / 143630 2 / 100058 -- 2 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 4 / 32606     1 / 11737 4 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 21 / 479819     5 / 207932 21 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 28 / 133582 56 / 10193077 -- 2 / 38063 28 / 133582 56 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 3 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 3 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --