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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.421608Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 825 / 3316537 866 / 2498449 331160 / 114162531 303821 / 109592465 825 / 3316537 866 / 2498449 331160 / 114162531 303821 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   25 / 57865 --   0 / 16077 25 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 6 / 14774 12 / 29891 5872 / 5047110 3098 / 4978364 6 / 14774 12 / 29891 5872 / 5047110 3098 / 4978364
brain 25 / 506301 42 / 200215 187 / 729526 3109 / 4997811 25 / 506301 42 / 200215 187 / 729526 3109 / 4997811
cartilage 3 / 15965 12 / 37226 -- 76 / 778035 3 / 15965 12 / 37226 -- 76 / 778035
cerebellum 2 / 90353   10 / 90885 1440 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 10 / 90885 1440 / 1495938
cerebrum 14 / 198932   -- -- 14 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 28 / 44577 -- -- 1 / 3888 28 / 44577 -- --
colon 10 / 26551 93 / 151167 3 / 98089 148 / 643586 10 / 26551 93 / 151167 3 / 98089 148 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 67 / 246043   -- -- 67 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 2 / 2857 -- -- 3 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 29 / 128826 37 / 46440 12 / 85898 43624 / 12434232 29 / 128826 37 / 46440 12 / 85898 43624 / 12434232
gastrointestinal tract 9 / 28803 3 / 12721 8 / 45908 -- 9 / 28803 3 / 12721 8 / 45908 --
heart 35 / 76442   56 / 83063 -- 35 / 76442 0 / 1 56 / 83063 --
kidney 10 / 106627 23 / 89898 71 / 155372 44 / 100281 10 / 106627 23 / 89898 71 / 155372 44 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 22 / 96846 37 / 107249 58 / 66308 200 / 214987 22 / 96846 37 / 107249 58 / 66308 200 / 214987
lung 48 / 128150 63 / 170663 132 / 159917 98 / 159059 48 / 128150 63 / 170663 132 / 159917 98 / 159059
lymph node 12 / 62650 18 / 27007 17438 / 5278419 80001 / 4863489 12 / 62650 18 / 27007 17438 / 5278419 80001 / 4863489
lymphoreticular 18 / 17836 26 / 44303 -- -- 18 / 17836 26 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 28 / 104307 1029 / 43166038 26560 / 30312656 7 / 46553 28 / 104307 1029 / 43166038 26560 / 30312656
muscle 18 / 74039 21 / 27691 48 / 107836 46 / 61270 18 / 74039 21 / 27691 48 / 107836 46 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 6 / 89988 108 / 94887 42 / 179472 5 / 11462 6 / 89988 108 / 94887 42 / 179472
pancreas 23 / 7237 19 / 74930 40 / 85728 96 / 189999 23 / 7237 19 / 74930 40 / 85728 96 / 189999
pancreatic islet 98 / 96524 1 / 30072 -- -- 98 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891 1 / 645 -- -- 1 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 4 / 13260 1 / 1358 -- -- 4 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 32 / 241088 16 / 39531 143 / 207348 -- 32 / 241088 16 / 39531 143 / 207348 --
pooled tissue 65 / 276455   -- -- 65 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 21 / 79993 30 / 107080 494 / 266949 147 / 491794 21 / 79993 30 / 107080 494 / 266949 147 / 491794
retina 4 / 29438 -- 217 / 820326 384 / 88490 4 / 29438 -- 217 / 820326 384 / 88490
salivary gland   7 / 10368 -- -- 0 / 2490 7 / 10368 -- --
skin 30 / 73633 53 / 125377 152647 / 26905847 126028 / 34522313 30 / 73633 53 / 125377 152647 / 26905847 126028 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 13 / 52939   -- -- 13 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 45696 / 6230144 -- -- -- 45696 / 6230144 --
stomach 9 / 26641 12 / 65644 46 / 124767 254 / 448716 9 / 26641 12 / 65644 46 / 124767 254 / 448716
synovium   2 / 1650 -- -- 0 / 249 2 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 44 / 100058 -- 18161 / 12372003 12 / 143630 44 / 100058 -- 18161 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   17 / 32606 96 / 115938 186 / 124664 0 / 11737 17 / 32606 96 / 115938 186 / 124664
uncharacterized tissue 139 / 207932 116 / 479819 11 / 21833 79 / 51729 139 / 207932 116 / 479819 11 / 21833 79 / 51729
uterus 4 / 38063 57 / 133582 18696 / 10193077 -- 4 / 38063 57 / 133582 18696 / 10193077 --
vascular 17 / 46250 -- 87632 / 13135050 -- 17 / 46250 -- 87632 / 13135050 --
white blood cells -- -- 410 / 846268 -- -- -- 410 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --