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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.421245Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 575 / 3316537 533 / 2498449 4396 / 114162531 5092 / 109592465 575 / 3316537 533 / 2498449 4396 / 114162531 5092 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 6 / 57865 -- 6 / 83577 4 / 16077 6 / 57865 -- 6 / 83577
bone marrow   10 / 29891 169 / 5047110 85 / 4978364 0 / 14774 10 / 29891 169 / 5047110 85 / 4978364
brain 73 / 506301 66 / 200215 15 / 729526 157 / 4997811 73 / 506301 66 / 200215 15 / 729526 157 / 4997811
cartilage 1 / 15965 8 / 37226 -- 57 / 778035 1 / 15965 8 / 37226 -- 57 / 778035
cerebellum 32 / 90353   3 / 90885 19 / 1495938 32 / 90353 0 / 0 3 / 90885 19 / 1495938
cerebrum 26 / 198932 4 / 3422 -- -- 26 / 198932 4 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 9 / 44577 -- -- 2 / 3888 9 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 19 / 151167 2 / 98089 23 / 643586 7 / 26551 19 / 151167 2 / 98089 23 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564   -- -- 6 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   13 / 17290 -- -- 0 / 270 13 / 17290 -- --
eye 18 / 128826 21 / 46440 1 / 85898 1600 / 12434232 18 / 128826 21 / 46440 1 / 85898 1600 / 12434232
gastrointestinal tract 10 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 -- 10 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 --
heart 27 / 76442   2 / 83063 -- 27 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 7 / 106627 24 / 89898 14 / 155372 1 / 100281 7 / 106627 24 / 89898 14 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 11 / 96846 26 / 107249 1 / 66308 7 / 214987 11 / 96846 26 / 107249 1 / 66308 7 / 214987
lung 27 / 128150 18 / 170663 3 / 159917 8 / 159059 27 / 128150 18 / 170663 3 / 159917 8 / 159059
lymph node 3 / 62650 3 / 27007 104 / 5278419 33 / 4863489 3 / 62650 3 / 27007 104 / 5278419 33 / 4863489
lymphoreticular 6 / 17836 11 / 44303 -- -- 6 / 17836 11 / 44303 -- --
mammary gland   46 / 104307 687 / 43166038 1426 / 30312656 0 / 46553 46 / 104307 687 / 43166038 1426 / 30312656
muscle 5 / 74039 13 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 5 / 74039 13 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 22 / 89988 2 / 94887 7 / 179472 1 / 11462 22 / 89988 2 / 94887 7 / 179472
pancreas   4 / 74930 1 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 10 / 30072 -- -- 7 / 96524 10 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 25 / 241088 12 / 39531 3 / 207348 -- 25 / 241088 12 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 13 / 79993 25 / 107080 3 / 266949 14 / 491794 13 / 79993 25 / 107080 3 / 266949 14 / 491794
retina 5 / 29438 -- 26 / 820326 5 / 88490 5 / 29438 -- 26 / 820326 5 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 48 / 125377 1162 / 26905847 1278 / 34522313 4 / 73633 48 / 125377 1162 / 26905847 1278 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 18 / 52939   -- -- 18 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 614 / 6230144 -- -- -- 614 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 9 / 65644 4 / 124767 11 / 448716 2 / 26641 9 / 65644 4 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 77 / 143630 9 / 100058 -- 337 / 12372003 77 / 143630 9 / 100058 -- 337 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 7 / 32606 2 / 115938 4 / 124664 2 / 11737 7 / 32606 2 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 71 / 207932 48 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 71 / 207932 48 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus 7 / 38063 35 / 133582 418 / 10193077 -- 7 / 38063 35 / 133582 418 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 1115 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 1115 / 13135050 --
white blood cells -- -- 41 / 846268 -- -- -- 41 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --