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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.419240Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1295 / 3316537 1507 / 2498449 5073 / 114162531 6272 / 109592465 1295 / 3316537 1507 / 2498449 5073 / 114162531 6272 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 10 / 29891 78 / 5047110 81 / 4978364 1 / 14774 10 / 29891 78 / 5047110 81 / 4978364
brain 273 / 506301 11 / 200215 63 / 729526 162 / 4997811 273 / 506301 11 / 200215 63 / 729526 162 / 4997811
cartilage 9 / 15965 2 / 37226 -- 28 / 778035 9 / 15965 2 / 37226 -- 28 / 778035
cerebellum 56 / 90353   5 / 90885 16 / 1495938 56 / 90353 0 / 0 5 / 90885 16 / 1495938
cerebrum 185 / 198932   -- -- 185 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 7 / 151167   99 / 643586 2 / 26551 7 / 151167 0 / 98089 99 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 274 / 246043   -- -- 274 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 2 / 2857 -- -- 2 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   8 / 17290 -- -- 0 / 270 8 / 17290 -- --
eye 12 / 128826 3 / 46440   69 / 12434232 12 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 69 / 12434232
gastrointestinal tract 9 / 28803 42 / 12721   -- 9 / 28803 42 / 12721 0 / 45908 --
heart 9 / 76442     -- 9 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 40 / 106627 8 / 89898 4 / 155372 31 / 100281 40 / 106627 8 / 89898 4 / 155372 31 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 21 / 107249   4 / 214987 13 / 96846 21 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 72 / 128150 9 / 170663 9 / 159917 3 / 159059 72 / 128150 9 / 170663 9 / 159917 3 / 159059
lymph node 5 / 62650   82 / 5278419   5 / 62650 0 / 27007 82 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 5 / 104307 3309 / 43166038 1032 / 30312656 2 / 46553 5 / 104307 3309 / 43166038 1032 / 30312656
muscle 3 / 74039 2 / 27691     3 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988   4 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 0 / 94887 4 / 179472
pancreas 1 / 7237   1 / 85728 2 / 189999 1 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 9 / 14891   -- -- 9 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 76 / 241088 8 / 39531 10 / 207348 -- 76 / 241088 8 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993     1 / 491794 11 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina   -- 42 / 820326 6 / 88490 0 / 29438 -- 42 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 14 / 73633 2 / 125377 22 / 26905847 513 / 34522313 14 / 73633 2 / 125377 22 / 26905847 513 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 34 / 52939   -- -- 34 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1157 / 6230144 -- -- -- 1157 / 6230144 --
stomach   4 / 65644   8 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 0 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 872 / 100058 -- 4207 / 12372003 5 / 143630 872 / 100058 -- 4207 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     6 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 140 / 207932 473 / 479819   4 / 51729 140 / 207932 473 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 1 / 38063 3 / 133582 93 / 10193077 -- 1 / 38063 3 / 133582 93 / 10193077 --
vascular 9 / 46250 -- 123 / 13135050 -- 9 / 46250 -- 123 / 13135050 --
white blood cells -- -- 69 / 846268 -- -- -- 69 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --