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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.415117Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 170 / 3316537 97 / 2498449 2490 / 114162531 3011 / 109592465 170 / 3316537 97 / 2498449 2490 / 114162531 3011 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077   --   5 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 2 / 5047110 4 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 2 / 5047110 4 / 4978364
brain 35 / 506301 10 / 200215 25 / 729526 148 / 4997811 35 / 506301 10 / 200215 25 / 729526 148 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 8 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 1 / 90353   4 / 90885 28 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 4 / 90885 28 / 1495938
cerebrum 23 / 198932 1 / 3422 -- -- 23 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167   2 / 643586 1 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 1 / 2857 -- -- 4 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826     363 / 12434232 9 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 363 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 11 / 89898 1 / 155372   2 / 106627 11 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 1 / 107249 1 / 66308   1 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 6 / 128150 4 / 170663 2 / 159917 9 / 159059 6 / 128150 4 / 170663 2 / 159917 9 / 159059
lymph node 6 / 62650   145 / 5278419 19 / 4863489 6 / 62650 0 / 27007 145 / 5278419 19 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 288 / 43166038 329 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 288 / 43166038 329 / 30312656
muscle 4 / 74039 1 / 27691     4 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   1 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080   3 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 3 / 491794
retina 1 / 29438 -- 45 / 820326 3 / 88490 1 / 29438 -- 45 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 9 / 125377 1452 / 26905847 2061 / 34522313 3 / 73633 9 / 125377 1452 / 26905847 2061 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 21 / 6230144 -- -- -- 21 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 3 / 124767   0 / 26641 1 / 65644 3 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 5 / 100058 -- 22 / 12372003 17 / 143630 5 / 100058 -- 22 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   9 / 32606 4 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 9 / 32606 4 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 26 / 479819 1 / 21833 3 / 51729 7 / 207932 26 / 479819 1 / 21833 3 / 51729
uterus 2 / 38063 1 / 133582 233 / 10193077 -- 2 / 38063 1 / 133582 233 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 227 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 227 / 13135050 --
white blood cells -- -- 34 / 846268 -- -- -- 34 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --