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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.413748Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 70 / 3316537 75 / 2498449 1502 / 114162531 2229 / 109592465 70 / 3316537 75 / 2498449 1502 / 114162531 2229 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 4 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow       6 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 6 / 4978364
brain 19 / 506301 7 / 200215 39 / 729526 96 / 4997811 19 / 506301 7 / 200215 39 / 729526 96 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 7 / 90353   15 / 90885 64 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 15 / 90885 64 / 1495938
cerebrum 14 / 198932   -- -- 14 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   10 / 151167   22 / 643586 0 / 26551 10 / 151167 0 / 98089 22 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye   1 / 46440 1 / 85898 486 / 12434232 0 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 486 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 1 / 155372 3 / 100281 1 / 106627 3 / 89898 1 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249 3 / 66308   0 / 96846 1 / 107249 3 / 66308 0 / 214987
lung 4 / 128150 4 / 170663   2 / 159059 4 / 128150 4 / 170663 0 / 159917 2 / 159059
lymph node     16 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 16 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 218 / 43166038 498 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 218 / 43166038 498 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 1 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988   3 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas   4 / 74930 1 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 -- 3 / 241088 1 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   2 / 107080 5 / 266949 23 / 491794 0 / 79993 2 / 107080 5 / 266949 23 / 491794
retina 5 / 29438 -- 28 / 820326 4 / 88490 5 / 29438 -- 28 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 3 / 125377 851 / 26905847 821 / 34522313 1 / 73633 3 / 125377 851 / 26905847 821 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 84 / 6230144 -- -- -- 84 / 6230144 --
stomach       3 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 4 / 100058 -- 179 / 12372003 1 / 143630 4 / 100058 -- 179 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue   15 / 479819     0 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   8 / 133582 141 / 10193077 -- 0 / 38063 8 / 133582 141 / 10193077 --
vascular   -- 94 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 94 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --