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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.412587Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 132 / 3316537 94 / 2498449 5995 / 114162531 9479 / 109592465 132 / 3316537 94 / 2498449 5995 / 114162531 9479 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   4 / 29891 80 / 5047110 55 / 4978364 0 / 14774 4 / 29891 80 / 5047110 55 / 4978364
brain 21 / 506301 8 / 200215 50 / 729526 353 / 4997811 21 / 506301 8 / 200215 50 / 729526 353 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 11 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum 1 / 90353   6 / 90885 281 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 6 / 90885 281 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   13 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 13 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye   5 / 46440 3 / 85898 340 / 12434232 0 / 128826 5 / 46440 3 / 85898 340 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721 3 / 45908 -- 0 / 28803 1 / 12721 3 / 45908 --
heart 2 / 76442   7 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 7 / 83063 --
kidney 10 / 106627 2 / 89898 9 / 155372 11 / 100281 10 / 106627 2 / 89898 9 / 155372 11 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 7 / 107249 11 / 66308 40 / 214987 1 / 96846 7 / 107249 11 / 66308 40 / 214987
lung 3 / 128150 3 / 170663 15 / 159917 7 / 159059 3 / 128150 3 / 170663 15 / 159917 7 / 159059
lymph node 6 / 62650 1 / 27007 899 / 5278419 2430 / 4863489 6 / 62650 1 / 27007 899 / 5278419 2430 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 8 / 104307 52 / 43166038 1695 / 30312656 2 / 46553 8 / 104307 52 / 43166038 1695 / 30312656
muscle 2 / 74039   6 / 107836 3 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 6 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 12 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 12 / 94887 10 / 179472
pancreas       20 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 20 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088 3 / 39531 31 / 207348 -- 12 / 241088 3 / 39531 31 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 2 / 107080 81 / 266949 37 / 491794 4 / 79993 2 / 107080 81 / 266949 37 / 491794
retina 2 / 29438 -- 118 / 820326 16 / 88490 2 / 29438 -- 118 / 820326 16 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 5 / 125377 1875 / 26905847 2663 / 34522313 17 / 73633 5 / 125377 1875 / 26905847 2663 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 449 / 6230144 -- -- -- 449 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 6 / 124767 29 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 6 / 124767 29 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 1 / 100058 -- 1441 / 12372003 5 / 143630 1 / 100058 -- 1441 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     9 / 115938 16 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 9 / 115938 16 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 23 / 479819 3 / 21833 8 / 51729 7 / 207932 23 / 479819 3 / 21833 8 / 51729
uterus 1 / 38063 3 / 133582 473 / 10193077 -- 1 / 38063 3 / 133582 473 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 1784 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 1784 / 13135050 --
white blood cells -- -- 13 / 846268 -- -- -- 13 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --