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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.409934Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 235 / 3316537 184 / 2498449 8545 / 114162531 9207 / 109592465 235 / 3316537 184 / 2498449 8545 / 114162531 9207 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 1 / 57865 --   1 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   84 / 5047110 179 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 84 / 5047110 179 / 4978364
brain 12 / 506301 4 / 200215 7 / 729526 342 / 4997811 12 / 506301 4 / 200215 7 / 729526 342 / 4997811
cartilage   7 / 37226 -- 1 / 778035 0 / 15965 7 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum       18 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 18 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 11 / 26551 7 / 151167 1 / 98089 5 / 643586 11 / 26551 7 / 151167 1 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 6 / 128826     106 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 106 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     3 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 3 / 106627 7 / 89898 5 / 155372 6 / 100281 3 / 106627 7 / 89898 5 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249   15 / 214987 0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 15 / 214987
lung 16 / 128150 27 / 170663 46 / 159917 44 / 159059 16 / 128150 27 / 170663 46 / 159917 44 / 159059
lymph node 19 / 62650 16 / 27007 4210 / 5278419 1057 / 4863489 19 / 62650 16 / 27007 4210 / 5278419 1057 / 4863489
lymphoreticular 26 / 17836 15 / 44303 -- -- 26 / 17836 15 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 5 / 104307 213 / 43166038 3912 / 30312656 8 / 46553 5 / 104307 213 / 43166038 3912 / 30312656
muscle 3 / 74039   3 / 107836 3 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 3 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 15 / 89988   17 / 179472 1 / 11462 15 / 89988 0 / 94887 17 / 179472
pancreas   5 / 74930   8 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 8 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   1 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 32 / 276455   -- -- 32 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 8 / 107080 13 / 266949 16 / 491794 5 / 79993 8 / 107080 13 / 266949 16 / 491794
retina   -- 13 / 820326   0 / 29438 -- 13 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   3 / 125377 3335 / 26905847 3395 / 34522313 0 / 73633 3 / 125377 3335 / 26905847 3395 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 24 / 52939   -- -- 24 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 22 / 6230144 -- -- -- 22 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 4 / 65644 7 / 124767 50 / 448716 3 / 26641 4 / 65644 7 / 124767 50 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 1 / 100058 -- 11 / 12372003 1 / 143630 1 / 100058 -- 11 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 7 / 32606 19 / 115938 22 / 124664 2 / 11737 7 / 32606 19 / 115938 22 / 124664
uncharacterized tissue 34 / 207932 29 / 479819     34 / 207932 29 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 18 / 133582 245 / 10193077 -- 1 / 38063 18 / 133582 245 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 4 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 4 / 13135050 --
white blood cells -- -- 313 / 846268 -- -- -- 313 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --