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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.409230Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 269 / 3316537 304 / 2498449 2091 / 114162531 1685 / 109592465 269 / 3316537 304 / 2498449 2091 / 114162531 1685 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   7 / 57865 -- 13 / 83577 0 / 16077 7 / 57865 -- 13 / 83577
bone marrow   2 / 29891 45 / 5047110 31 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 45 / 5047110 31 / 4978364
brain 48 / 506301 37 / 200215 72 / 729526 324 / 4997811 48 / 506301 37 / 200215 72 / 729526 324 / 4997811
cartilage 2 / 15965 3 / 37226 -- 58 / 778035 2 / 15965 3 / 37226 -- 58 / 778035
cerebellum 8 / 90353   4 / 90885 59 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 4 / 90885 59 / 1495938
cerebrum 26 / 198932   -- -- 26 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 10 / 26551 10 / 151167 3 / 98089 41 / 643586 10 / 26551 10 / 151167 3 / 98089 41 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 24 / 246043   -- -- 24 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 12 / 46440 11 / 85898 370 / 12434232 16 / 128826 12 / 46440 11 / 85898 370 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 5 / 12721 1 / 45908 -- 3 / 28803 5 / 12721 1 / 45908 --
heart 6 / 76442   1 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 6 / 106627 10 / 89898 8 / 155372 5 / 100281 6 / 106627 10 / 89898 8 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 4 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 3 / 128150 16 / 170663 2 / 159917 7 / 159059 3 / 128150 16 / 170663 2 / 159917 7 / 159059
lymph node 3 / 62650   37 / 5278419 3 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 37 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 9 / 104307 1281 / 43166038 203 / 30312656 1 / 46553 9 / 104307 1281 / 43166038 203 / 30312656
muscle 5 / 74039 2 / 27691 6 / 107836   5 / 74039 2 / 27691 6 / 107836 0 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 7 / 89988 9 / 94887 18 / 179472 3 / 11462 7 / 89988 9 / 94887 18 / 179472
pancreas   17 / 74930 6 / 85728 19 / 189999 0 / 7237 17 / 74930 6 / 85728 19 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260 1 / 1358 -- -- 1 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 25 / 241088 10 / 39531 2 / 207348 -- 25 / 241088 10 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 8 / 107080 7 / 266949 38 / 491794 4 / 79993 8 / 107080 7 / 266949 38 / 491794
retina 2 / 29438 -- 17 / 820326 3 / 88490 2 / 29438 -- 17 / 820326 3 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 13 / 73633 25 / 125377 183 / 26905847 232 / 34522313 13 / 73633 25 / 125377 183 / 26905847 232 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 127 / 6230144 -- -- -- 127 / 6230144 --
stomach   5 / 65644   10 / 448716 0 / 26641 5 / 65644 0 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 13 / 100058 -- 242 / 12372003 10 / 143630 13 / 100058 -- 242 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 5 / 32606 2 / 115938 2 / 124664 2 / 11737 5 / 32606 2 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 63 / 479819 3 / 21833 3 / 51729 18 / 207932 63 / 479819 3 / 21833 3 / 51729
uterus 2 / 38063 9 / 133582 177 / 10193077 -- 2 / 38063 9 / 133582 177 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 69 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 69 / 13135050 --
white blood cells -- -- 17 / 846268 -- -- -- 17 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --