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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.406475Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1007 / 3316537 376 / 2498449 25697 / 114162531 64333 / 109592465 1007 / 3316537 376 / 2498449 25697 / 114162531 64333 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 7 / 16077 26 / 57865 -- 1 / 83577 7 / 16077 26 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 3 / 14774 1 / 29891 8 / 5047110 10 / 4978364 3 / 14774 1 / 29891 8 / 5047110 10 / 4978364
brain 11 / 506301 6 / 200215 3 / 729526 127 / 4997811 11 / 506301 6 / 200215 3 / 729526 127 / 4997811
cartilage 41 / 15965 14 / 37226 -- 242 / 778035 41 / 15965 14 / 37226 -- 242 / 778035
cerebellum       73 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 73 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 15 / 3888   -- -- 15 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 22 / 151167   2 / 643586 7 / 26551 22 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 7 / 16130 -- -- -- 7 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 116 / 246043   -- -- 116 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 10 / 19564 1 / 2857 -- -- 10 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270 14 / 17290 -- -- 1 / 270 14 / 17290 -- --
eye 9 / 128826   12 / 85898 91 / 12434232 9 / 128826 0 / 46440 12 / 85898 91 / 12434232
gastrointestinal tract 30 / 28803 14 / 12721 2 / 45908 -- 30 / 28803 14 / 12721 2 / 45908 --
heart 51 / 76442   13 / 83063 -- 51 / 76442 0 / 1 13 / 83063 --
kidney 15 / 106627 7 / 89898   1 / 100281 15 / 106627 7 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 12 / 107249 6 / 66308 10 / 214987 4 / 96846 12 / 107249 6 / 66308 10 / 214987
lung 102 / 128150 9 / 170663 33 / 159917 12 / 159059 102 / 128150 9 / 170663 33 / 159917 12 / 159059
lymph node   3 / 27007 1373 / 5278419 132 / 4863489 0 / 62650 3 / 27007 1373 / 5278419 132 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 13 / 46553 5 / 104307 13630 / 43166038 36293 / 30312656 13 / 46553 5 / 104307 13630 / 43166038 36293 / 30312656
muscle 11 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 21 / 61270 11 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 21 / 61270
nervous 8 / 10333   -- -- 8 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 9 / 89988   29 / 179472 5 / 11462 9 / 89988 0 / 94887 29 / 179472
pancreas   60 / 74930 1 / 85728 28 / 189999 0 / 7237 60 / 74930 1 / 85728 28 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 4 / 30072 -- -- 6 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 345 / 241088   80 / 207348 -- 345 / 241088 0 / 39531 80 / 207348 --
pooled tissue 26 / 276455   -- -- 26 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 4 / 107080 52 / 266949 27 / 491794 8 / 79993 4 / 107080 52 / 266949 27 / 491794
retina 2 / 29438 -- 17 / 820326   2 / 29438 -- 17 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 13 / 73633 3 / 125377 8103 / 26905847 27073 / 34522313 13 / 73633 3 / 125377 8103 / 26905847 27073 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 65 / 6230144 -- -- -- 65 / 6230144 --
stomach 15 / 26641 24 / 65644 8 / 124767 105 / 448716 15 / 26641 24 / 65644 8 / 124767 105 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 4 / 100058 -- 39 / 12372003 14 / 143630 4 / 100058 -- 39 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     22 / 115938 9 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 22 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 70 / 207932 84 / 479819   8 / 51729 70 / 207932 84 / 479819 0 / 21833 8 / 51729
uterus 26 / 38063 47 / 133582 2112 / 10193077 -- 26 / 38063 47 / 133582 2112 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 153 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 153 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --