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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.406062Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 237 / 3316537 134 / 2498449 6885 / 114162531 6953 / 109592465 237 / 3316537 134 / 2498449 6885 / 114162531 6953 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   7 / 57865 -- 78 / 83577 0 / 16077 7 / 57865 -- 78 / 83577
bone marrow   1 / 29891 603 / 5047110 1035 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 603 / 5047110 1035 / 4978364
brain 13 / 506301 13 / 200215 119 / 729526 995 / 4997811 13 / 506301 13 / 200215 119 / 729526 995 / 4997811
cartilage     -- 312 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 312 / 778035
cerebellum 1 / 90353   10 / 90885 311 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 10 / 90885 311 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 9 / 151167 15 / 98089 130 / 643586 1 / 26551 9 / 151167 15 / 98089 130 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 17 / 246043   -- -- 17 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 3 / 46440 22 / 85898 788 / 12434232 11 / 128826 3 / 46440 22 / 85898 788 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 2 / 12721   -- 4 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442   24 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 24 / 83063 --
kidney 4 / 106627 8 / 89898 55 / 155372 11 / 100281 4 / 106627 8 / 89898 55 / 155372 11 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 5 / 107249 7 / 66308 10 / 214987 2 / 96846 5 / 107249 7 / 66308 10 / 214987
lung 9 / 128150 6 / 170663 31 / 159917 20 / 159059 9 / 128150 6 / 170663 31 / 159917 20 / 159059
lymph node 4 / 62650   607 / 5278419 179 / 4863489 4 / 62650 0 / 27007 607 / 5278419 179 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 5 / 44303 -- -- 1 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland 10 / 46553 4 / 104307 2841 / 43166038 1207 / 30312656 10 / 46553 4 / 104307 2841 / 43166038 1207 / 30312656
muscle 25 / 74039   29 / 107836 7 / 61270 25 / 74039 0 / 27691 29 / 107836 7 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 11 / 89988 17 / 94887 33 / 179472 1 / 11462 11 / 89988 17 / 94887 33 / 179472
pancreas   4 / 74930 17 / 85728 44 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 17 / 85728 44 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 2 / 30072 -- -- 1 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 6 / 6170 -- -- -- 6 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 7 / 39531 22 / 207348 -- 20 / 241088 7 / 39531 22 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 10 / 107080 58 / 266949 140 / 491794 7 / 79993 10 / 107080 58 / 266949 140 / 491794
retina 12 / 29438 -- 99 / 820326 8 / 88490 12 / 29438 -- 99 / 820326 8 / 88490
salivary gland   5 / 10368 -- -- 0 / 2490 5 / 10368 -- --
skin 10 / 73633 7 / 125377 640 / 26905847 644 / 34522313 10 / 73633 7 / 125377 640 / 26905847 644 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 572 / 6230144 -- -- -- 572 / 6230144 --
stomach 1 / 26641   3 / 124767 49 / 448716 1 / 26641 0 / 65644 3 / 124767 49 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630   -- 937 / 12372003 6 / 143630 0 / 100058 -- 937 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   11 / 115938 13 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 11 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 14 / 479819 13 / 21833 2 / 51729 6 / 207932 14 / 479819 13 / 21833 2 / 51729
uterus 11 / 38063 5 / 133582 351 / 10193077 -- 11 / 38063 5 / 133582 351 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 618 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 618 / 13135050 --
white blood cells -- -- 101 / 846268 -- -- -- 101 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --