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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.405590Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 656 / 3316537 937 / 2498449 19976 / 114162531 23374 / 109592465 656 / 3316537 937 / 2498449 19976 / 114162531 23374 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   26 / 57865 -- 2 / 83577 0 / 16077 26 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 4 / 14774 62 / 29891 1489 / 5047110 965 / 4978364 4 / 14774 62 / 29891 1489 / 5047110 965 / 4978364
brain 50 / 506301 59 / 200215 42 / 729526 565 / 4997811 50 / 506301 59 / 200215 42 / 729526 565 / 4997811
cartilage 5 / 15965 7 / 37226 -- 79 / 778035 5 / 15965 7 / 37226 -- 79 / 778035
cerebellum 7 / 90353   5 / 90885 223 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 5 / 90885 223 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   16 / 44577 -- -- 0 / 3888 16 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 34 / 151167 3 / 98089 72 / 643586 2 / 26551 34 / 151167 3 / 98089 72 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 125 / 246043   -- -- 125 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 14 / 128826 40 / 46440 9 / 85898 3221 / 12434232 14 / 128826 40 / 46440 9 / 85898 3221 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 5 / 12721 8 / 45908 -- 2 / 28803 5 / 12721 8 / 45908 --
heart 22 / 76442   5 / 83063 -- 22 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 18 / 106627 21 / 89898 48 / 155372 1 / 100281 18 / 106627 21 / 89898 48 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 15 / 96846 45 / 107249 1 / 66308 23 / 214987 15 / 96846 45 / 107249 1 / 66308 23 / 214987
lung 26 / 128150 39 / 170663 14 / 159917 16 / 159059 26 / 128150 39 / 170663 14 / 159917 16 / 159059
lymph node 11 / 62650 16 / 27007 1372 / 5278419 4588 / 4863489 11 / 62650 16 / 27007 1372 / 5278419 4588 / 4863489
lymphoreticular   11 / 44303 -- -- 0 / 17836 11 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 48 / 104307 197 / 43166038 5787 / 30312656 2 / 46553 48 / 104307 197 / 43166038 5787 / 30312656
muscle 42 / 74039 8 / 27691 5 / 107836 7 / 61270 42 / 74039 8 / 27691 5 / 107836 7 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 8 / 11462 18 / 89988 10 / 94887 30 / 179472 8 / 11462 18 / 89988 10 / 94887 30 / 179472
pancreas   17 / 74930 9 / 85728 29 / 189999 0 / 7237 17 / 74930 9 / 85728 29 / 189999
pancreatic islet 20 / 96524 5 / 30072 -- -- 20 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 6 / 14891   -- -- 6 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 7 / 13260   -- -- 7 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 43 / 241088 15 / 39531 19 / 207348 -- 43 / 241088 15 / 39531 19 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 59 / 107080 49 / 266949 80 / 491794 12 / 79993 59 / 107080 49 / 266949 80 / 491794
retina 1 / 29438 -- 26 / 820326 16 / 88490 1 / 29438 -- 26 / 820326 16 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 35 / 125377 5699 / 26905847 4230 / 34522313 11 / 73633 35 / 125377 5699 / 26905847 4230 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 9 / 52939   -- -- 9 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5342 / 6230144 -- -- -- 5342 / 6230144 --
stomach   19 / 65644 13 / 124767 59 / 448716 0 / 26641 19 / 65644 13 / 124767 59 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 31 / 143630 78 / 100058 -- 3350 / 12372003 31 / 143630 78 / 100058 -- 3350 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 9 / 32606 23 / 115938 25 / 124664 2 / 11737 9 / 32606 23 / 115938 25 / 124664
uncharacterized tissue 63 / 207932 157 / 479819   6 / 51729 63 / 207932 157 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus 13 / 38063 76 / 133582 2241 / 10193077 -- 13 / 38063 76 / 133582 2241 / 10193077 --
vascular 19 / 46250 -- 3292 / 13135050 -- 19 / 46250 -- 3292 / 13135050 --
white blood cells -- -- 55 / 846268 -- -- -- 55 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --