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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.404568Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 194 / 3316537 129 / 2498449 3717 / 114162531 3400 / 109592465 194 / 3316537 129 / 2498449 3717 / 114162531 3400 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 -- 39 / 83577 0 / 16077 6 / 57865 -- 39 / 83577
bone marrow 1 / 14774 1 / 29891 18 / 5047110 69 / 4978364 1 / 14774 1 / 29891 18 / 5047110 69 / 4978364
brain 16 / 506301 7 / 200215 49 / 729526 175 / 4997811 16 / 506301 7 / 200215 49 / 729526 175 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 226 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 226 / 778035
cerebellum 1 / 90353   3 / 90885 48 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 3 / 90885 48 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon   10 / 151167 1 / 98089 34 / 643586 0 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 34 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 10 / 246043   -- -- 10 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 12 / 128826   5 / 85898 333 / 12434232 12 / 128826 0 / 46440 5 / 85898 333 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   3 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 4 / 106627 2 / 89898 22 / 155372 1 / 100281 4 / 106627 2 / 89898 22 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   6 / 107249   3 / 214987 0 / 96846 6 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 6 / 128150 6 / 170663 11 / 159917 13 / 159059 6 / 128150 6 / 170663 11 / 159917 13 / 159059
lymph node 5 / 62650 5 / 27007 120 / 5278419 9 / 4863489 5 / 62650 5 / 27007 120 / 5278419 9 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 8 / 44303 -- -- 2 / 17836 8 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 9 / 104307 642 / 43166038 1275 / 30312656 3 / 46553 9 / 104307 642 / 43166038 1275 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836 4 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988 7 / 94887 10 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 7 / 94887 10 / 179472
pancreas   10 / 74930   18 / 189999 0 / 7237 10 / 74930 0 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524   -- -- 10 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891 1 / 645 -- -- 2 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 36 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 -- 36 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 32 / 276455   -- -- 32 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 7 / 107080 12 / 266949 20 / 491794 5 / 79993 7 / 107080 12 / 266949 20 / 491794
retina   -- 9 / 820326   0 / 29438 -- 9 / 820326 0 / 88490
salivary gland   5 / 10368 -- -- 0 / 2490 5 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 8 / 125377 994 / 26905847 892 / 34522313 5 / 73633 8 / 125377 994 / 26905847 892 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 221 / 6230144 -- -- -- 221 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 7 / 65644   11 / 448716 1 / 26641 7 / 65644 0 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630   -- 213 / 12372003 6 / 143630 0 / 100058 -- 213 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606 4 / 115938 5 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 4 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 11 / 207932 12 / 479819 2 / 21833 2 / 51729 11 / 207932 12 / 479819 2 / 21833 2 / 51729
uterus 3 / 38063 4 / 133582 515 / 10193077 -- 3 / 38063 4 / 133582 515 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 962 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 962 / 13135050 --
white blood cells -- -- 114 / 846268 -- -- -- 114 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --