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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.400740Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 728 / 3316537 481 / 2498449 1999 / 114162531 3069 / 109592465 728 / 3316537 481 / 2498449 1999 / 114162531 3069 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 14 / 57865 -- 2 / 83577 2 / 16077 14 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow   3 / 29891 8 / 5047110 6 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 8 / 5047110 6 / 4978364
brain 172 / 506301 54 / 200215 41 / 729526 164 / 4997811 172 / 506301 54 / 200215 41 / 729526 164 / 4997811
cartilage 4 / 15965 2 / 37226 -- 16 / 778035 4 / 15965 2 / 37226 -- 16 / 778035
cerebellum 33 / 90353   6 / 90885 24 / 1495938 33 / 90353 0 / 0 6 / 90885 24 / 1495938
cerebrum 80 / 198932   -- -- 80 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 5 / 3888 16 / 44577 -- -- 5 / 3888 16 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 24 / 151167 2 / 98089 72 / 643586 2 / 26551 24 / 151167 2 / 98089 72 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 39 / 246043   -- -- 39 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 8 / 19564   -- -- 8 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 19 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 56 / 12434232 19 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 56 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803 4 / 12721   -- 6 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 17 / 76442   3 / 83063 -- 17 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 15 / 106627 21 / 89898 10 / 155372 7 / 100281 15 / 106627 21 / 89898 10 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 15 / 107249     3 / 96846 15 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 39 / 128150 30 / 170663 5 / 159917 4 / 159059 39 / 128150 30 / 170663 5 / 159917 4 / 159059
lymph node 4 / 62650 3 / 27007 44 / 5278419 9 / 4863489 4 / 62650 3 / 27007 44 / 5278419 9 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 2 / 44303 -- -- 2 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 22 / 104307 233 / 43166038 1427 / 30312656 9 / 46553 22 / 104307 233 / 43166038 1427 / 30312656
muscle 17 / 74039   10 / 107836 2 / 61270 17 / 74039 0 / 27691 10 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 6 / 11462 17 / 89988 5 / 94887 14 / 179472 6 / 11462 17 / 89988 5 / 94887 14 / 179472
pancreas   12 / 74930 7 / 85728 9 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 7 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 28 / 241088 20 / 39531 1 / 207348 -- 28 / 241088 20 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 36 / 276455   -- -- 36 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 22 / 79993 27 / 107080 8 / 266949 37 / 491794 22 / 79993 27 / 107080 8 / 266949 37 / 491794
retina   -- 5 / 820326   0 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland   4 / 10368 -- -- 0 / 2490 4 / 10368 -- --
skin 15 / 73633 24 / 125377 636 / 26905847 1009 / 34522313 15 / 73633 24 / 125377 636 / 26905847 1009 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 14 / 52939   -- -- 14 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 307 / 6230144 -- -- -- 307 / 6230144 --
stomach 6 / 26641 4 / 65644   7 / 448716 6 / 26641 4 / 65644 0 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 58 / 143630 35 / 100058 -- 203 / 12372003 58 / 143630 35 / 100058 -- 203 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737 2 / 32606   1 / 124664 4 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 38 / 207932 102 / 479819 1 / 21833   38 / 207932 102 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 5 / 38063 16 / 133582 216 / 10193077 -- 5 / 38063 16 / 133582 216 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 391 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 391 / 13135050 --
white blood cells -- -- 58 / 846268 -- -- -- 58 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --