Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.3989Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 274 / 3316537 380 / 2498449 9187 / 114162531 1919 / 109592465 274 / 3316537 380 / 2498449 9187 / 114162531 1919 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 2 / 57865 -- 33 / 83577 3 / 16077 2 / 57865 -- 33 / 83577
bone marrow     2 / 5047110 5 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 5 / 4978364
brain 30 / 506301 18 / 200215 58 / 729526 294 / 4997811 30 / 506301 18 / 200215 58 / 729526 294 / 4997811
cartilage   9 / 37226 -- 195 / 778035 0 / 15965 9 / 37226 -- 195 / 778035
cerebellum 19 / 90353   8 / 90885 39 / 1495938 19 / 90353 0 / 0 8 / 90885 39 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 39 / 151167 25 / 98089 61 / 643586 2 / 26551 39 / 151167 25 / 98089 61 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 26 / 246043   -- -- 26 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 28 / 128826 5 / 46440 11 / 85898 116 / 12434232 28 / 128826 5 / 46440 11 / 85898 116 / 12434232
gastrointestinal tract   8 / 12721 3 / 45908 -- 0 / 28803 8 / 12721 3 / 45908 --
heart 5 / 76442   1 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 7 / 106627 26 / 89898 18 / 155372 4 / 100281 7 / 106627 26 / 89898 18 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 3 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 11 / 128150 17 / 170663 11 / 159917 21 / 159059 11 / 128150 17 / 170663 11 / 159917 21 / 159059
lymph node 22 / 62650 2 / 27007 34 / 5278419 2 / 4863489 22 / 62650 2 / 27007 34 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 19 / 104307 7676 / 43166038 539 / 30312656 9 / 46553 19 / 104307 7676 / 43166038 539 / 30312656
muscle 6 / 74039 19 / 27691   3 / 61270 6 / 74039 19 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 38 / 89988 6 / 94887 18 / 179472 1 / 11462 38 / 89988 6 / 94887 18 / 179472
pancreas   29 / 74930 5 / 85728 38 / 189999 0 / 7237 29 / 74930 5 / 85728 38 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 7 / 14891   -- -- 7 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088   2 / 207348 -- 24 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 9 / 276455   -- -- 9 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 17 / 107080 13 / 266949 30 / 491794 12 / 79993 17 / 107080 13 / 266949 30 / 491794
retina 1 / 29438 -- 15 / 820326   1 / 29438 -- 15 / 820326 0 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 14 / 125377 368 / 26905847 357 / 34522313 4 / 73633 14 / 125377 368 / 26905847 357 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 73 / 6230144 -- -- -- 73 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 15 / 65644 2 / 124767 89 / 448716 2 / 26641 15 / 65644 2 / 124767 89 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 13 / 100058 -- 65 / 12372003 9 / 143630 13 / 100058 -- 65 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 7 / 32606 3 / 115938 6 / 124664 3 / 11737 7 / 32606 3 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 35 / 479819 1 / 21833   9 / 207932 35 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 24 / 133582 536 / 10193077 -- 1 / 38063 24 / 133582 536 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 180 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 180 / 13135050 --
white blood cells -- -- 135 / 846268 -- -- -- 135 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --