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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.397609Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1041 / 3316537 1627 / 2498449 111182 / 114162531 25504 / 109592465 1041 / 3316537 1627 / 2498449 111182 / 114162531 25504 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 26 / 57865 -- 412 / 83577 4 / 16077 26 / 57865 -- 412 / 83577
bone marrow 16 / 14774 3 / 29891 2792 / 5047110 5227 / 4978364 16 / 14774 3 / 29891 2792 / 5047110 5227 / 4978364
brain 85 / 506301 71 / 200215 269 / 729526 2733 / 4997811 85 / 506301 71 / 200215 269 / 729526 2733 / 4997811
cartilage 3 / 15965 4 / 37226 -- 969 / 778035 3 / 15965 4 / 37226 -- 969 / 778035
cerebellum 5 / 90353   24 / 90885 847 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 24 / 90885 847 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 24 / 44577 -- -- 3 / 3888 24 / 44577 -- --
colon 20 / 26551 45 / 151167 78 / 98089 896 / 643586 20 / 26551 45 / 151167 78 / 98089 896 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 300 / 246043   -- -- 300 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564 1 / 2857 -- -- 6 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 38 / 128826 31 / 46440 115 / 85898 2569 / 12434232 38 / 128826 31 / 46440 115 / 85898 2569 / 12434232
gastrointestinal tract 13 / 28803 6 / 12721 12 / 45908 -- 13 / 28803 6 / 12721 12 / 45908 --
heart 31 / 76442   38 / 83063 -- 31 / 76442 0 / 1 38 / 83063 --
kidney 13 / 106627 24 / 89898 176 / 155372 109 / 100281 13 / 106627 24 / 89898 176 / 155372 109 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 16 / 96846 65 / 107249 6 / 66308 104 / 214987 16 / 96846 65 / 107249 6 / 66308 104 / 214987
lung 49 / 128150 61 / 170663 157 / 159917 152 / 159059 49 / 128150 61 / 170663 157 / 159917 152 / 159059
lymph node 2 / 62650 15 / 27007 4232 / 5278419 1014 / 4863489 2 / 62650 15 / 27007 4232 / 5278419 1014 / 4863489
lymphoreticular 21 / 17836 31 / 44303 -- -- 21 / 17836 31 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 38 / 104307 90965 / 43166038 3485 / 30312656 4 / 46553 38 / 104307 90965 / 43166038 3485 / 30312656
muscle 58 / 74039 41 / 27691 114 / 107836 27 / 61270 58 / 74039 41 / 27691 114 / 107836 27 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 139 / 89988 300 / 94887 293 / 179472 3 / 11462 139 / 89988 300 / 94887 293 / 179472
pancreas   449 / 74930 495 / 85728 1336 / 189999 0 / 7237 449 / 74930 495 / 85728 1336 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 1 / 30072 -- -- 4 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 12 / 13260   -- -- 12 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 28 / 241088 51 / 39531 65 / 207348 -- 28 / 241088 51 / 39531 65 / 207348 --
pooled tissue 90 / 276455   -- -- 90 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 31 / 79993 72 / 107080 455 / 266949 1091 / 491794 31 / 79993 72 / 107080 455 / 266949 1091 / 491794
retina 9 / 29438 -- 233 / 820326 12 / 88490 9 / 29438 -- 233 / 820326 12 / 88490
salivary gland   11 / 10368 -- -- 0 / 2490 11 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 103 / 125377 2768 / 26905847 1230 / 34522313 4 / 73633 103 / 125377 2768 / 26905847 1230 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 36 / 52939   -- -- 36 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2460 / 6230144 -- -- -- 2460 / 6230144 --
stomach 8 / 26641 26 / 65644 33 / 124767 230 / 448716 8 / 26641 26 / 65644 33 / 124767 230 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 9 / 100058 -- 2673 / 12372003 9 / 143630 9 / 100058 -- 2673 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   11 / 32606 32 / 115938 72 / 124664 0 / 11737 11 / 32606 32 / 115938 72 / 124664
uncharacterized tissue 66 / 207932 89 / 479819 83 / 21833 23 / 51729 66 / 207932 89 / 479819 83 / 21833 23 / 51729
uterus 15 / 38063 166 / 133582 3709 / 10193077 -- 15 / 38063 166 / 133582 3709 / 10193077 --
vascular 14 / 46250 -- 1085 / 13135050 -- 14 / 46250 -- 1085 / 13135050 --
white blood cells -- -- 486 / 846268 -- -- -- 486 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --