Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.390567Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 171 / 3316537 88 / 2498449 2126 / 114162531 3125 / 109592465 171 / 3316537 88 / 2498449 2126 / 114162531 3125 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 3 / 57865 --   3 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     2 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 0 / 4978364
brain 23 / 506301 18 / 200215 53 / 729526 433 / 4997811 23 / 506301 18 / 200215 53 / 729526 433 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 8 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum     5 / 90885 174 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 5 / 90885 174 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 1 / 44577 -- -- 1 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   5 / 151167   2 / 643586 0 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826   4 / 85898 332 / 12434232 11 / 128826 0 / 46440 4 / 85898 332 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   3 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 5 / 155372   6 / 106627 4 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249 2 / 66308 4 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 2 / 66308 4 / 214987
lung 8 / 128150 3 / 170663 7 / 159917 2 / 159059 8 / 128150 3 / 170663 7 / 159917 2 / 159059
lymph node 2 / 62650 3 / 27007 382 / 5278419 72 / 4863489 2 / 62650 3 / 27007 382 / 5278419 72 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 4 / 104307 248 / 43166038 1093 / 30312656 1 / 46553 4 / 104307 248 / 43166038 1093 / 30312656
muscle   2 / 27691   1 / 61270 0 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462   5 / 94887 1 / 179472 2 / 11462 0 / 89988 5 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 1 / 30072 -- -- 5 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   2 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     9 / 266949 3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 9 / 266949 3 / 491794
retina 3 / 29438 -- 36 / 820326 6 / 88490 3 / 29438 -- 36 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 14 / 73633 5 / 125377 466 / 26905847 668 / 34522313 14 / 73633 5 / 125377 466 / 26905847 668 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 76 / 6230144 -- -- -- 76 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 5 / 65644 5 / 124767 7 / 448716 1 / 26641 5 / 65644 5 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 312 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 312 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 10 / 32606 3 / 115938 5 / 124664 3 / 11737 10 / 32606 3 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 14 / 479819     8 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 6 / 133582 368 / 10193077 -- 2 / 38063 6 / 133582 368 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 410 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 410 / 13135050 --
white blood cells -- -- 34 / 846268 -- -- -- 34 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --