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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.389649Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 269 / 3316537 367 / 2498449 19823 / 114162531 39851 / 109592465 269 / 3316537 367 / 2498449 19823 / 114162531 39851 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 8 / 57865 --   5 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   873 / 5047110 92 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 873 / 5047110 92 / 4978364
brain 22 / 506301 19 / 200215 21 / 729526 276 / 4997811 22 / 506301 19 / 200215 21 / 729526 276 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 10 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 5 / 90353   1 / 90885 61 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 1 / 90885 61 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 22 / 151167 1 / 98089 48 / 643586 1 / 26551 22 / 151167 1 / 98089 48 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 35 / 246043   -- -- 35 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 16 / 46440 2 / 85898 6602 / 12434232 2 / 128826 16 / 46440 2 / 85898 6602 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 5 / 12721 1 / 45908 -- 4 / 28803 5 / 12721 1 / 45908 --
heart 5 / 76442   4 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 5 / 106627 7 / 89898 6 / 155372 4 / 100281 5 / 106627 7 / 89898 6 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 10 / 107249 3 / 66308 15 / 214987 1 / 96846 10 / 107249 3 / 66308 15 / 214987
lung 18 / 128150 34 / 170663 4 / 159917 11 / 159059 18 / 128150 34 / 170663 4 / 159917 11 / 159059
lymph node 5 / 62650 12 / 27007 327 / 5278419 626 / 4863489 5 / 62650 12 / 27007 327 / 5278419 626 / 4863489
lymphoreticular   16 / 44303 -- -- 0 / 17836 16 / 44303 -- --
mammary gland 10 / 46553 9 / 104307 722 / 43166038 8321 / 30312656 10 / 46553 9 / 104307 722 / 43166038 8321 / 30312656
muscle 1 / 74039 9 / 27691 1 / 107836 3 / 61270 1 / 74039 9 / 27691 1 / 107836 3 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   18 / 89988 2 / 94887 8 / 179472 0 / 11462 18 / 89988 2 / 94887 8 / 179472
pancreas   16 / 74930 2 / 85728   0 / 7237 16 / 74930 2 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 13 / 96524   -- -- 13 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 31 / 241088 12 / 39531 12 / 207348 -- 31 / 241088 12 / 39531 12 / 207348 --
pooled tissue 23 / 276455   -- -- 23 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 13 / 107080 11 / 266949 14 / 491794 7 / 79993 13 / 107080 11 / 266949 14 / 491794
retina 2 / 29438 -- 31 / 820326 18 / 88490 2 / 29438 -- 31 / 820326 18 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 29 / 125377 8058 / 26905847 20803 / 34522313 5 / 73633 29 / 125377 8058 / 26905847 20803 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2022 / 6230144 -- -- -- 2022 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 7 / 65644 1 / 124767 11 / 448716 2 / 26641 7 / 65644 1 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 6 / 100058 -- 2915 / 12372003 13 / 143630 6 / 100058 -- 2915 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 9 / 115938 7 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 9 / 115938 7 / 124664
uncharacterized tissue 33 / 207932 56 / 479819   6 / 51729 33 / 207932 56 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus 3 / 38063 25 / 133582 649 / 10193077 -- 3 / 38063 25 / 133582 649 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 7003 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 7003 / 13135050 --
white blood cells -- -- 57 / 846268 -- -- -- 57 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --