Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.388918Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 86 / 3316537 27 / 2498449 768 / 114162531 385 / 109592465 86 / 3316537 27 / 2498449 768 / 114162531 385 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   19 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 19 / 5047110 0 / 4978364
brain 5 / 506301   9 / 729526 31 / 4997811 5 / 506301 0 / 200215 9 / 729526 31 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 25 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 25 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 11 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 11 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 18 / 12434232 7 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 18 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 3 / 89898 4 / 155372   3 / 106627 3 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 2 / 107249     1 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150 2 / 170663 1 / 159917 1 / 159059 3 / 128150 2 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node 4 / 62650   18 / 5278419 3 / 4863489 4 / 62650 0 / 27007 18 / 5278419 3 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     297 / 43166038 121 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 297 / 43166038 121 / 30312656
muscle 1 / 74039   1 / 107836   1 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   3 / 74930 1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 17 / 241088     -- 17 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993       2 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 7 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633   97 / 26905847 142 / 34522313 4 / 73633 0 / 125377 97 / 26905847 142 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 11 / 6230144 -- -- -- 11 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   4 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 7 / 143630 1 / 100058 -- 25 / 12372003 7 / 143630 1 / 100058 -- 25 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 2 / 479819     3 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 1 / 133582 226 / 10193077 -- 3 / 38063 1 / 133582 226 / 10193077 --
vascular   -- 65 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 65 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --