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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.388400Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 101 / 3316537 68 / 2498449 1844 / 114162531 2267 / 109592465 101 / 3316537 68 / 2498449 1844 / 114162531 2267 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 2 / 57865 --   2 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   5 / 29891   11 / 4978364 0 / 14774 5 / 29891 0 / 5047110 11 / 4978364
brain 16 / 506301 4 / 200215 43 / 729526 130 / 4997811 16 / 506301 4 / 200215 43 / 729526 130 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum 3 / 90353   4 / 90885 62 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 4 / 90885 62 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   8 / 151167 1 / 98089 8 / 643586 0 / 26551 8 / 151167 1 / 98089 8 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 13 / 246043   -- -- 13 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 319 / 12434232 4 / 128826 5 / 46440 1 / 85898 319 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   1 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 5 / 106627 3 / 89898 3 / 155372   5 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 7 / 107249 4 / 66308 2 / 214987 5 / 96846 7 / 107249 4 / 66308 2 / 214987
lung 2 / 128150 1 / 170663 4 / 159917   2 / 128150 1 / 170663 4 / 159917 0 / 159059
lymph node 3 / 62650 1 / 27007 97 / 5278419 18 / 4863489 3 / 62650 1 / 27007 97 / 5278419 18 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 5 / 104307 280 / 43166038 401 / 30312656 3 / 46553 5 / 104307 280 / 43166038 401 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836 1 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 5 / 179472
pancreas     1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 4 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   3 / 107080 2 / 266949 7 / 491794 0 / 79993 3 / 107080 2 / 266949 7 / 491794
retina 1 / 29438 -- 21 / 820326 4 / 88490 1 / 29438 -- 21 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 7 / 125377 689 / 26905847 831 / 34522313 1 / 73633 7 / 125377 689 / 26905847 831 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 207 / 6230144 -- -- -- 207 / 6230144 --
stomach 1 / 26641     11 / 448716 1 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 3 / 100058 -- 444 / 12372003 6 / 143630 3 / 100058 -- 444 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     5 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 4 / 479819   1 / 51729 2 / 207932 4 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 6 / 38063 8 / 133582 274 / 10193077 -- 6 / 38063 8 / 133582 274 / 10193077 --
vascular   -- 183 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 183 / 13135050 --
white blood cells -- -- 19 / 846268 -- -- -- 19 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --