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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.387679Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 318 / 3316537 204 / 2498449 2835 / 114162531 11176 / 109592465 318 / 3316537 204 / 2498449 2835 / 114162531 11176 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   --   2 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   96 / 5047110 17 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 96 / 5047110 17 / 4978364
brain 14 / 506301 2 / 200215 35 / 729526 189 / 4997811 14 / 506301 2 / 200215 35 / 729526 189 / 4997811
cartilage   8 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 8 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum     5 / 90885 62 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 5 / 90885 62 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   20 / 151167   3 / 643586 0 / 26551 20 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 1 / 2857 -- -- 4 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826   2 / 85898 147 / 12434232 7 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 147 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803     -- 3 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 4 / 106627 10 / 89898 6 / 155372 5 / 100281 4 / 106627 10 / 89898 6 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 3 / 107249   3 / 214987 5 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 25 / 128150 19 / 170663 91 / 159917 22 / 159059 25 / 128150 19 / 170663 91 / 159917 22 / 159059
lymph node 30 / 62650 24 / 27007 58 / 5278419 1259 / 4863489 30 / 62650 24 / 27007 58 / 5278419 1259 / 4863489
lymphoreticular 21 / 17836 27 / 44303 -- -- 21 / 17836 27 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 4 / 104307 57 / 43166038 6907 / 30312656 1 / 46553 4 / 104307 57 / 43166038 6907 / 30312656
muscle 1 / 74039   9 / 107836 11 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 9 / 107836 11 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 9 / 89988 1 / 94887 3 / 179472 1 / 11462 9 / 89988 1 / 94887 3 / 179472
pancreas   9 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 9 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 4 / 30072 -- -- 7 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088   6 / 207348 -- 7 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 41 / 276455   -- -- 41 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 3 / 107080 7 / 266949 5 / 491794 6 / 79993 3 / 107080 7 / 266949 5 / 491794
retina 4 / 29438 -- 60 / 820326 5 / 88490 4 / 29438 -- 60 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 3 / 125377 1389 / 26905847 2306 / 34522313 1 / 73633 3 / 125377 1389 / 26905847 2306 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 8 / 52939   -- -- 8 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 33 / 6230144 -- -- -- 33 / 6230144 --
stomach 35 / 26641 6 / 65644   5 / 448716 35 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 220 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 220 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 1 / 32606 10 / 115938 3 / 124664 3 / 11737 1 / 32606 10 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 61 / 207932 32 / 479819     61 / 207932 32 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 11 / 133582 346 / 10193077 -- 4 / 38063 11 / 133582 346 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 346 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 346 / 13135050 --
white blood cells -- -- 276 / 846268 -- -- -- 276 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --