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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.387208Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 833 / 3316537 636 / 2498449 187591 / 114162531 43040 / 109592465 833 / 3316537 636 / 2498449 187591 / 114162531 43040 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 15 / 57865 -- 171 / 83577 2 / 16077 15 / 57865 -- 171 / 83577
bone marrow 14 / 14774 6 / 29891 4736 / 5047110 7119 / 4978364 14 / 14774 6 / 29891 4736 / 5047110 7119 / 4978364
brain 49 / 506301 49 / 200215 425 / 729526 2869 / 4997811 49 / 506301 49 / 200215 425 / 729526 2869 / 4997811
cartilage 1 / 15965 5 / 37226 -- 554 / 778035 1 / 15965 5 / 37226 -- 554 / 778035
cerebellum 2 / 90353   33 / 90885 982 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 33 / 90885 982 / 1495938
cerebrum 26 / 198932 2 / 3422 -- -- 26 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix   9 / 44577 -- -- 0 / 3888 9 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 27 / 151167 50 / 98089 680 / 643586 7 / 26551 27 / 151167 50 / 98089 680 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 116 / 246043   -- -- 116 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 7 / 19564 2 / 2857 -- -- 7 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 31 / 128826 4 / 46440 58 / 85898 6465 / 12434232 31 / 128826 4 / 46440 58 / 85898 6465 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803 3 / 12721 24 / 45908 -- 6 / 28803 3 / 12721 24 / 45908 --
heart 35 / 76442   54 / 83063 -- 35 / 76442 0 / 1 54 / 83063 --
kidney 19 / 106627 27 / 89898 105 / 155372 53 / 100281 19 / 106627 27 / 89898 105 / 155372 53 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 23 / 96846 37 / 107249 22 / 66308 96 / 214987 23 / 96846 37 / 107249 22 / 66308 96 / 214987
lung 62 / 128150 49 / 170663 122 / 159917 106 / 159059 62 / 128150 49 / 170663 122 / 159917 106 / 159059
lymph node 7 / 62650 7 / 27007 4322 / 5278419 1946 / 4863489 7 / 62650 7 / 27007 4322 / 5278419 1946 / 4863489
lymphoreticular 12 / 17836 6 / 44303 -- -- 12 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 31 / 104307 144043 / 43166038 8005 / 30312656 9 / 46553 31 / 104307 144043 / 43166038 8005 / 30312656
muscle 43 / 74039 10 / 27691 82 / 107836 25 / 61270 43 / 74039 10 / 27691 82 / 107836 25 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 53 / 89988 57 / 94887 115 / 179472 2 / 11462 53 / 89988 57 / 94887 115 / 179472
pancreas   18 / 74930 72 / 85728 195 / 189999 0 / 7237 18 / 74930 72 / 85728 195 / 189999
pancreatic islet 14 / 96524 4 / 30072 -- -- 14 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   14 / 20557 -- -- 0 / 24 14 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 12 / 13260   -- -- 12 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 31 / 241088 5 / 39531 93 / 207348 -- 31 / 241088 5 / 39531 93 / 207348 --
pooled tissue 85 / 276455   -- -- 85 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 53 / 79993 92 / 107080 208 / 266949 511 / 491794 53 / 79993 92 / 107080 208 / 266949 511 / 491794
retina 10 / 29438 -- 260 / 820326 42 / 88490 10 / 29438 -- 260 / 820326 42 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 14 / 73633 24 / 125377 13155 / 26905847 6912 / 34522313 14 / 73633 24 / 125377 13155 / 26905847 6912 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5509 / 6230144 -- -- -- 5509 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 9 / 65644 79 / 124767 307 / 448716 2 / 26641 9 / 65644 79 / 124767 307 / 448716
synovium 2 / 249 3 / 1650 -- -- 2 / 249 3 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 10 / 100058 -- 5782 / 12372003 17 / 143630 10 / 100058 -- 5782 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 5 / 32606 97 / 115938 82 / 124664 2 / 11737 5 / 32606 97 / 115938 82 / 124664
uncharacterized tissue 87 / 207932 82 / 479819 28 / 21833 23 / 51729 87 / 207932 82 / 479819 28 / 21833 23 / 51729
uterus 4 / 38063 21 / 133582 8086 / 10193077 -- 4 / 38063 21 / 133582 8086 / 10193077 --
vascular 14 / 46250 -- 5046 / 13135050 -- 14 / 46250 -- 5046 / 13135050 --
white blood cells -- -- 825 / 846268 -- -- -- 825 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --