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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.374503Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 806 / 3316537 629 / 2498449 26587 / 114162531 27184 / 109592465 806 / 3316537 629 / 2498449 26587 / 114162531 27184 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 26 / 57865 -- 2 / 83577 1 / 16077 26 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 8 / 14774 6 / 29891 388 / 5047110 339 / 4978364 8 / 14774 6 / 29891 388 / 5047110 339 / 4978364
brain 114 / 506301 44 / 200215 129 / 729526 1232 / 4997811 114 / 506301 44 / 200215 129 / 729526 1232 / 4997811
cartilage 2 / 15965 15 / 37226 -- 244 / 778035 2 / 15965 15 / 37226 -- 244 / 778035
cerebellum 11 / 90353   35 / 90885 474 / 1495938 11 / 90353 0 / 0 35 / 90885 474 / 1495938
cerebrum 26 / 198932   -- -- 26 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 14 / 44577 -- -- 1 / 3888 14 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 23 / 151167 5 / 98089 25 / 643586 7 / 26551 23 / 151167 5 / 98089 25 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 139 / 246043   -- -- 139 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 7 / 19564   -- -- 7 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 35 / 128826 19 / 46440 36 / 85898 3149 / 12434232 35 / 128826 19 / 46440 36 / 85898 3149 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803 6 / 12721 5 / 45908 -- 5 / 28803 6 / 12721 5 / 45908 --
heart 35 / 76442   22 / 83063 -- 35 / 76442 0 / 1 22 / 83063 --
kidney 12 / 106627 21 / 89898 18 / 155372 18 / 100281 12 / 106627 21 / 89898 18 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 17 / 96846 23 / 107249 9 / 66308 28 / 214987 17 / 96846 23 / 107249 9 / 66308 28 / 214987
lung 30 / 128150 20 / 170663 35 / 159917 27 / 159059 30 / 128150 20 / 170663 35 / 159917 27 / 159059
lymph node 5 / 62650 8 / 27007 680 / 5278419 586 / 4863489 5 / 62650 8 / 27007 680 / 5278419 586 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 10 / 44303 -- -- 5 / 17836 10 / 44303 -- --
mammary gland 12 / 46553 23 / 104307 11570 / 43166038 7027 / 30312656 12 / 46553 23 / 104307 11570 / 43166038 7027 / 30312656
muscle 18 / 74039 8 / 27691 6 / 107836 2 / 61270 18 / 74039 8 / 27691 6 / 107836 2 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 14 / 89988 16 / 94887 23 / 179472 5 / 11462 14 / 89988 16 / 94887 23 / 179472
pancreas 6 / 7237 17 / 74930 9 / 85728 33 / 189999 6 / 7237 17 / 74930 9 / 85728 33 / 189999
pancreatic islet 36 / 96524 19 / 30072 -- -- 36 / 96524 19 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 8 / 13260   -- -- 8 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 56 / 241088 20 / 39531 53 / 207348 -- 56 / 241088 20 / 39531 53 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 29 / 107080 36 / 266949 54 / 491794 7 / 79993 29 / 107080 36 / 266949 54 / 491794
retina 2 / 29438 -- 136 / 820326 10 / 88490 2 / 29438 -- 136 / 820326 10 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 25 / 73633 51 / 125377 4267 / 26905847 7018 / 34522313 25 / 73633 51 / 125377 4267 / 26905847 7018 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1393 / 6230144 -- -- -- 1393 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 11 / 65644 24 / 124767 103 / 448716 4 / 26641 11 / 65644 24 / 124767 103 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 45 / 143630 28 / 100058 -- 6732 / 12372003 45 / 143630 28 / 100058 -- 6732 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   16 / 32606 41 / 115938 44 / 124664 0 / 11737 16 / 32606 41 / 115938 44 / 124664
uncharacterized tissue 41 / 207932 86 / 479819 2 / 21833 14 / 51729 41 / 207932 86 / 479819 2 / 21833 14 / 51729
uterus 12 / 38063 56 / 133582 4118 / 10193077 -- 12 / 38063 56 / 133582 4118 / 10193077 --
vascular 17 / 46250 -- 3504 / 13135050 -- 17 / 46250 -- 3504 / 13135050 --
white blood cells -- -- 50 / 846268 -- -- -- 50 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --