Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.370254Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 136 / 3316537 118 / 2498449 1778 / 114162531 1061 / 109592465 136 / 3316537 118 / 2498449 1778 / 114162531 1061 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 26 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 26 / 83577
bone marrow     17 / 5047110 13 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 17 / 5047110 13 / 4978364
brain 13 / 506301 13 / 200215 39 / 729526 247 / 4997811 13 / 506301 13 / 200215 39 / 729526 247 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 89 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 89 / 778035
cerebellum     3 / 90885 31 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 31 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   15 / 151167 8 / 98089 39 / 643586 0 / 26551 15 / 151167 8 / 98089 39 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 19 / 128826 8 / 46440 11 / 85898 52 / 12434232 19 / 128826 8 / 46440 11 / 85898 52 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442   1 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 7 / 106627 4 / 89898 9 / 155372 6 / 100281 7 / 106627 4 / 89898 9 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249     2 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 11 / 128150 13 / 170663 8 / 159917 17 / 159059 11 / 128150 13 / 170663 8 / 159917 17 / 159059
lymph node 9 / 62650   98 / 5278419 1 / 4863489 9 / 62650 0 / 27007 98 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 2 / 104307 906 / 43166038 254 / 30312656 1 / 46553 2 / 104307 906 / 43166038 254 / 30312656
muscle 1 / 74039   4 / 107836   1 / 74039 0 / 27691 4 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 5 / 89988 3 / 94887 10 / 179472 2 / 11462 5 / 89988 3 / 94887 10 / 179472
pancreas   8 / 74930 1 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 1 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891 1 / 645 -- -- 1 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088 1 / 39531 6 / 207348 -- 9 / 241088 1 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 8 / 107080 19 / 266949 39 / 491794 12 / 79993 8 / 107080 19 / 266949 39 / 491794
retina 3 / 29438 -- 30 / 820326 3 / 88490 3 / 29438 -- 30 / 820326 3 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 9 / 125377 221 / 26905847 113 / 34522313 6 / 73633 9 / 125377 221 / 26905847 113 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 36 / 6230144 -- -- -- 36 / 6230144 --
stomach       11 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 2 / 100058 -- 91 / 12372003 4 / 143630 2 / 100058 -- 91 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 3 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 3 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue   12 / 479819 16 / 21833 1 / 51729 0 / 207932 12 / 479819 16 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 7 / 133582 204 / 10193077 -- 1 / 38063 7 / 133582 204 / 10193077 --
vascular   -- 107 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 107 / 13135050 --
white blood cells -- -- 28 / 846268 -- -- -- 28 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --